More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2703 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 137 aa  274  3e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  72.06 
 
 		 142 aa  202  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  72.06 
 
 		 142 aa  202  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  59.12 
 
 		 149 aa  169  9e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  54.74 
 
 		 161 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  52.94 
 
 		 140 aa  144  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  49.64 
 
 		 159 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 148 aa  88.6  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  38.28 
 
 		 151 aa  85.5  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  32.56 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 174 aa  82  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  36.22 
 
 		 177 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2640  MarR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  32.82 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  40.57 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 157 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 157 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  33.59 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  39.39 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1552  MarR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 174 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 303 aa  74.3  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  32.31 
 
 		 171 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2133  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1620  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664296  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 174 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 161 aa  72  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3489  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483469 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3404  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4330  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28808  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4036  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2006  regulatory protein, MarR  40 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 153 aa  70.1  0.000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 205 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 201 aa  70.1  0.000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  35.16 
 
 		 140 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  31.09 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1287  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4553  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.561632 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  33.6 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  37.76 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 169 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  31.54 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  34.88 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0283  transcriptional regulator, MarR family  37.31 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.34751  hitchhiker  0.000254243 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  32.81 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  39.81 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  35.58 
 
 		 169 aa  67.8  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 172 aa  67.4  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 149 aa  67  0.00000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  39.62 
 
 		 156 aa  67  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  36.21 
 
 		 154 aa  66.6  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  32.33 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  34.26 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>