More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_43770 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 140 aa  277  4e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  96.95 
 
 		 140 aa  233  6e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  64.66 
 
 		 174 aa  169  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  57.35 
 
 		 153 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  57.46 
 
 		 180 aa  148  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6031  transcriptional regulator, MarR family  50.38 
 
 		 159 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  41.04 
 
 		 155 aa  105  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  39.71 
 
 		 160 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 158 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 158 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 158 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3489  MarR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 148 aa  95.9  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483469 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4330  MarR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 148 aa  95.9  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28808  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4036  MarR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 148 aa  95.9  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 158 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 158 aa  95.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4553  MarR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 161 aa  94  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.561632 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2313  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 157 aa  89  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  33.57 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  33.57 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 315 aa  75.5  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1859  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 172 aa  74.7  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  32.82 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  34.31 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 190 aa  71.2  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 157 aa  70.5  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 159 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  34.38 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1929  transcriptional regulator, MarR family  32.12 
 
 		 149 aa  67  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 153 aa  67  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  32.86 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 167 aa  63.9  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  33.09 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  33.57 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 174 aa  62  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 162 aa  62  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 184 aa  62  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 169 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 176 aa  62  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  28.97 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  34.93 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  28.97 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 170 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 175 aa  60.5  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2538  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 154 aa  60.1  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474386  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  28.97 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  32.28 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5723  transcriptional regulator, MarR family  29.85 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  28.97 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  39.81 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5755  transcriptional regulator, MarR family  33.81 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373966 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0283  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.34751  hitchhiker  0.000254243 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  39.8 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  30.6 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2522  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  26.72 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2661  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00131118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>