More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6813 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  296  6e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  64.54 
 
 		 158 aa  173  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  51.77 
 
 		 144 aa  144  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 167 aa  144  6e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  52.52 
 
 		 149 aa  135  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  46.58 
 
 		 159 aa  123  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2538  transcriptional regulator, MarR family  53.79 
 
 		 154 aa  120  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474386  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1929  transcriptional regulator, MarR family  42.03 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4592  transcriptional regulator, MarR family  55.94 
 
 		 152 aa  104  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0409464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  45 
 
 		 157 aa  102  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  37.14 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  40.17 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  41.12 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  42 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3615  transcriptional regulator, MarR family  37.4 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4466  transcriptional regulator, MarR family  37.8 
 
 		 179 aa  67.4  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.120137  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  39 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  34.55 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  40.74 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  33.91 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0560  transcriptional regulator, MarR family  34.72 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  29.53 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06310  transcriptional regulator  36.54 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  33.57 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  31.75 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  37.25 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3015  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  34.75 
 
 		 140 aa  57  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 303 aa  57  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6031  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3114  transcriptional regulator, MarR family  45.33 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000547755 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  25.86 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  34.45 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2764  transcriptional regulator, MarR family  39.81 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0619086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6003  MarR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 244 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5323  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5412  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5702  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  31.78 
 
 		 287 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  29.77 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 168 aa  53.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2650  transcriptional regulator, MarR family  26.79 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038621  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 205 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  29.77 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1105  transcriptional regulator, MarR family  35.82 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00926589  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2823  MarR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3088  transcriptional regulator, MarR family  37.76 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00891754  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6941  transcriptional regulator, MarR family  36.5 
 
 		 151 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  35.62 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 174 aa  51.6  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  28.8 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1950  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 152 aa  50.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2225  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 162 aa  51.2  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 161 aa  50.8  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0962  transcriptional regulator  25.84 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.632942  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 201 aa  50.8  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1297  regulatory protein, MarR  36.92 
 
 		 157 aa  50.8  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 159 aa  50.8  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3956  MarR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 148 aa  50.4  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5793  transcriptional regulator, MarR family  28.79 
 
 		 186 aa  50.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 149 aa  50.4  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4196  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 182 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003893  transcriptional regulator  28.71 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4033  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3866  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0257058  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3880  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230852  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1001  transcriptional regulator, MarR family  27.66 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4348  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 		 172 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4149  transcriptional regulator, MarR family  27.66 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>