More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B3015 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B3015  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 173 aa  351  2.9999999999999997e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9049  Transcriptional regulator  49.66 
 
 		 153 aa  150  5.9999999999999996e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578092  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  47.97 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  37.24 
 
 		 157 aa  115  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  33.05 
 
 		 147 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0259  transcriptional regulator, MarR family  27.33 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623858  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  32.73 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 171 aa  62  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  35.58 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  27.61 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  28.06 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2672  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 169 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 171 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2643  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 169 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2688  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 169 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0756972  normal  0.0190727 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  30.7 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  34.91 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2651  transcriptional regulator, MarR family  28.81 
 
 		 143 aa  53.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.512568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2878  MarR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 161 aa  52.4  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.149923 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  30.16 
 
 		 178 aa  52.4  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 170 aa  52.8  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3470  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 144 aa  52  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 172 aa  51.6  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2695  transcriptional regulator, MarR family  25.26 
 
 		 172 aa  51.6  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.21037  hitchhiker  0.0000565476 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  28.03 
 
 		 168 aa  51.6  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1685  MarR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 196 aa  51.6  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.402727  normal  0.628244 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2942  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 171 aa  51.2  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  32.26 
 
 		 157 aa  50.8  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 145 aa  50.8  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 147 aa  50.8  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  32.26 
 
 		 157 aa  50.8  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0818  transcriptional regulator, MarR family  25.71 
 
 		 147 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1148  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18479  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0860  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 151 aa  50.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194997  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1128  transcriptional regulator, MarR family  23.28 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  27.68 
 
 		 142 aa  50.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1648  MarR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.575498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1040  transcriptional regulator, MarR family  23.28 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.69196e-21 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 172 aa  50.1  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  27.36 
 
 		 142 aa  49.3  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0952  transcriptional regulator, MarR family  21.67 
 
 		 146 aa  49.3  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00612871  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  24 
 
 		 158 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 158 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 142 aa  48.9  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3330  transcription repressor  27.83 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0423629  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3505  MarR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 145 aa  49.3  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000513952 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2106  transcriptional regulator, MarR family  36.46 
 
 		 163 aa  49.3  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0650489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  31.94 
 
 		 142 aa  49.3  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2777  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 158 aa  49.3  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  normal  0.392987 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  32.22 
 
 		 158 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  27.27 
 
 		 162 aa  48.5  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2750  MarR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 139 aa  48.5  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.395044  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2027  MarR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 150 aa  48.9  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0422371 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2828  regulatory protein MarR  23.08 
 
 		 139 aa  48.5  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  33.73 
 
 		 155 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5817  MarR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 146 aa  48.9  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.127726 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2365  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 147 aa  48.5  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000820566  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 164 aa  48.5  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1045  MarR family transcriptional regulator  22.41 
 
 		 152 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.734934  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0900  MarR family transcriptional regulator  22.41 
 
 		 152 aa  48.5  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 165 aa  48.1  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 143 aa  48.1  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1197  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 182 aa  48.5  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0958  MarR family transcriptional regulator  22.41 
 
 		 152 aa  48.5  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  25.26 
 
 		 147 aa  48.5  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 		 165 aa  48.1  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 165 aa  48.1  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 165 aa  48.1  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1709  MarR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 178 aa  48.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592382  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 165 aa  48.1  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 150 aa  48.1  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2751  transcriptional regulator, MarR family  27.43 
 
 		 141 aa  47.8  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.290738  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3588  homoprotocatechuate degradation transcriptional regulator HpaR  28.41 
 
 		 164 aa  47.8  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0100  MarR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 141 aa  47.8  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 137 aa  47.8  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  30.77 
 
 		 157 aa  47.8  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0883  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 154 aa  47.8  0.00008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.736004  normal  0.090725 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 159 aa  47.8  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6358  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  31.19 
 
 		 326 aa  47.8  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  30.83 
 
 		 147 aa  47.8  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  25.26 
 
 		 140 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  26.12 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2336  MarR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 309 aa  47.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  27.2 
 
 		 153 aa  47.4  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1663  MarR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 132 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  32.71 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 145 aa  47.4  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.341405 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  27.59 
 
 		 177 aa  47  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2105  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000763901  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  27.55 
 
 		 152 aa  47.4  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>