More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4392 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  100 
 
 		 168 aa  330  4e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  51.7 
 
 		 157 aa  152  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  38.26 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 171 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4084  MarR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0692551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  39.05 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 167 aa  70.5  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  35.45 
 
 		 161 aa  70.5  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2317  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 151 aa  67  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  33.91 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  33.07 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  32.17 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  30.88 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  33.63 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 303 aa  65.5  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  37.59 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1134  MarR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  hitchhiker  0.0000997239 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1950  transcriptional regulator, MarR family  35.61 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  42.17 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3027  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 163 aa  63.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 148 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  31.67 
 
 		 171 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  32.74 
 
 		 172 aa  63.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  38.74 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  36.28 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  31.67 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 162 aa  62  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  23.02 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 139 aa  60.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  23.02 
 
 		 139 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 139 aa  60.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2729  regulatory protein, MarR  31.82 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  23.13 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  34.71 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  23.02 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  25.58 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  39.05 
 
 		 292 aa  58.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  26.15 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  33.9 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  36.29 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4187  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2945  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521959  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  33.33 
 
 		 287 aa  58.2  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  41.75 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 193 aa  57.8  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  44.05 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2082  MarR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4274  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  33.04 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 137 aa  57  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2467  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411287  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  29.09 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1876  transcriptional regulator, MarR family  34.35 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  24 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11880  transcriptional regulator  38.95 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 187 aa  54.3  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  30.3 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0524  multidrug resistance operon repressor MexR  30.3 
 
 		 147 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  43.06 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>