More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1307 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
159 aa  314  4e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2070  transcriptional regulator MarR  51.05 
 
 
151 aa  142  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.317078 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3512  MarR family transcriptional regulator  51.41 
 
 
156 aa  142  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332426  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  48.34 
 
 
158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  49.66 
 
 
158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4167  MarR family transcriptional regulator  49.66 
 
 
154 aa  138  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  48.61 
 
 
153 aa  135  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0359  MarR family transcriptional regulator  47.79 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000080599  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  43.55 
 
 
151 aa  108  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  41.04 
 
 
153 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  40.29 
 
 
142 aa  101  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2407  MarR family transcriptional regulator  43.26 
 
 
167 aa  100  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445055  normal  0.878491 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2658  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
169 aa  99.4  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563591  normal  0.690586 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5688  transcriptional regulator  39.74 
 
 
154 aa  97.4  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  38.97 
 
 
156 aa  97.1  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 
148 aa  95.9  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
141 aa  93.2  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03534  transcriptional regulator for cryptic hemolysin  43.9 
 
 
210 aa  92.4  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5772  MarR family transcriptional regulator  45.76 
 
 
159 aa  92  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.94508 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6016  MarR family transcriptional regulator  45.76 
 
 
159 aa  92  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 
151 aa  91.3  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6656  MarR family transcriptional regulator  42.52 
 
 
159 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  38.81 
 
 
144 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  38.73 
 
 
145 aa  90.1  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5812  MarR family transcriptional regulator  42.52 
 
 
159 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697265  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  38.06 
 
 
144 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6176  MarR family transcriptional regulator  42.52 
 
 
159 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.714929  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0135  MarR family transcriptional regulator  40.31 
 
 
157 aa  90.1  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0405255  normal  0.71696 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  38.73 
 
 
146 aa  89.4  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7721  MarR family transcriptional regulator  42.52 
 
 
159 aa  89.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4021  MarR family transcriptional regulator  38.52 
 
 
145 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  40.74 
 
 
157 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  39.85 
 
 
159 aa  89  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4007  transcriptional regulator, MarR family  37.59 
 
 
151 aa  87.8  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.063729 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4933  MarR family transcriptional regulator  40.14 
 
 
157 aa  88.2  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4794  putative MarR family transcriptional regulator  40.5 
 
 
152 aa  88.2  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.717119  normal  0.755619 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
145 aa  87.8  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4515  MarR family transcriptional regulator  37.7 
 
 
145 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934068  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1396  MarR family transcriptional regulator  37.7 
 
 
145 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6147  MarR family transcriptional regulator  43.22 
 
 
159 aa  86.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.676081  normal  0.847722 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2611  MarR family transcriptional regulator  38.93 
 
 
202 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1807  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
163 aa  85.5  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1469  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
144 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3804  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 
145 aa  84.7  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279751  hitchhiker  0.00000113316 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 
146 aa  84  9e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0170  MarR family transcriptional regulator  39.32 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  38.14 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6622  transcriptional regulator, MarR family  39.52 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 
165 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2635  transcriptional regulator, MarR family  39.83 
 
 
168 aa  82  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  37.76 
 
 
153 aa  82  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 
147 aa  81.6  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 
147 aa  81.6  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5052  MarR family transcriptional regulator  39.69 
 
 
150 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  34.92 
 
 
144 aa  80.5  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3581  MarR family transcriptional regulator  41.74 
 
 
160 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2319  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
155 aa  80.1  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.204664 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0504  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 
154 aa  80.1  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
160 aa  79  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0196  MarR family transcriptional regulator  41.03 
 
 
150 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149236  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  33.33 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0175  MarR family transcriptional regulator  41.03 
 
 
150 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0200  MarR family transcriptional regulator  41.03 
 
 
150 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.834737 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32790  Transcriptional regulator MarR family protein  34.92 
 
 
148 aa  76.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  36.23 
 
 
155 aa  77  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3377  regulatory protein, MarR  36.23 
 
 
150 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0974589  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3360  transcriptional regulator, MarR family  32.09 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  44.55 
 
 
149 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 
159 aa  74.3  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3617  transcriptional regulator, MarR family  36.75 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  36.22 
 
 
174 aa  73.9  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  35.86 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  41.13 
 
 
142 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0661  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 
159 aa  70.5  0.000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  41.53 
 
 
142 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3435  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
158 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0516  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.716514  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  39.52 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3610  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 
158 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0620  MarR family transcriptional regulator  34.53 
 
 
168 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3615  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 
158 aa  67.4  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210335  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  39.32 
 
 
140 aa  67  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4052  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
157 aa  67  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  30.83 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  30.83 
 
 
146 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  30.83 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  30.83 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  30.83 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000535  putative transcription regulator  29.51 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  30.83 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  36.04 
 
 
154 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 
158 aa  66.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  30.83 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  36.04 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
178 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>