More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3105 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
154 aa  315  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  96.75 
 
 
154 aa  306  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
174 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  42.96 
 
 
160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0096  MarR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
141 aa  113  8.999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  42.66 
 
 
182 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  43.88 
 
 
159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  40.3 
 
 
146 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
155 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
155 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  38.52 
 
 
146 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  38.52 
 
 
146 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  38.52 
 
 
146 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  38.52 
 
 
146 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
159 aa  98.2  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  42.11 
 
 
147 aa  97.1  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  39.26 
 
 
156 aa  96.3  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
155 aa  95.5  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  42.54 
 
 
162 aa  94.7  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
169 aa  95.1  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  41.35 
 
 
160 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  39.23 
 
 
161 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  36.69 
 
 
159 aa  91.3  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  43.44 
 
 
164 aa  90.1  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  42.59 
 
 
153 aa  86.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
142 aa  86.3  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
142 aa  86.3  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 
144 aa  86.3  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3908  transcriptional regulator, TrmB  34.09 
 
 
148 aa  82  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  37.5 
 
 
149 aa  80.5  0.000000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3794  transcriptional regulator  39.39 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  38.4 
 
 
141 aa  77  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  35.56 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  35.56 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  34.75 
 
 
146 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  35.56 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  35.56 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 
160 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  35.56 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  35.56 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 
165 aa  75.1  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  34.19 
 
 
176 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  37.6 
 
 
148 aa  74.7  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
159 aa  73.9  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 
150 aa  73.6  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  34.81 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  33.33 
 
 
146 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  33.33 
 
 
146 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  33.33 
 
 
146 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  33.33 
 
 
168 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1722  transcriptional regulator SlyA  34.33 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00118206  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  32.62 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  32.62 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  33.09 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
191 aa  67.8  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  30.88 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1689  transcriptional regulator SlyA  34.33 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2070  transcriptional regulator MarR  39.39 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.317078 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  35.2 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0661  transcriptional regulator, MarR family  34.33 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  36.28 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0436  MarR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
103 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0742867  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  29.08 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  34.15 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2214  transcriptional regulator SlyA  31.62 
 
 
144 aa  63.5  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559997  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  27.7 
 
 
147 aa  62.8  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  28.99 
 
 
147 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  28.99 
 
 
147 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2666  transcriptional regulator SlyA  32.84 
 
 
145 aa  61.6  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 
141 aa  61.6  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 
177 aa  61.2  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 
159 aa  61.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 
147 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  33.96 
 
 
153 aa  60.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1286  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 
147 aa  60.8  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.204943 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2382  transcriptional regulator SlyA  32.84 
 
 
145 aa  60.5  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00066282  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2677  MarR family transcriptional regulator  39.82 
 
 
153 aa  60.5  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1199  regulatory protein MarR  28.36 
 
 
153 aa  59.7  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 
151 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1767  transcriptional regulator SlyA  31.39 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000697661  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1876  transcriptional regulator SlyA  31.39 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116497  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6318  transcriptional regulator, MarR family  25.9 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2560  transcriptional regulator SlyA  31.39 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673945  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
148 aa  58.9  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 
170 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  31.2 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>