More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3538 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 153 aa  296  6e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  73.79 
 
 		 159 aa  209  7.999999999999999e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  40.88 
 
 		 161 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 182 aa  100  9e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  44.25 
 
 		 162 aa  95.5  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 160 aa  88.2  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 150 aa  88.2  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  42.59 
 
 		 154 aa  88.2  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  42.59 
 
 		 154 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 145 aa  86.7  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 191 aa  85.5  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 141 aa  85.1  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 174 aa  84.3  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 177 aa  80.1  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 165 aa  77.4  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  34.68 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5688  transcriptional regulator  34.53 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  34.68 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  34.68 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  34.68 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  34.68 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  34.68 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  39.09 
 
 		 149 aa  73.6  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  34.68 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  35.38 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  34.68 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1767  transcriptional regulator SlyA  33.87 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000697661  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1876  transcriptional regulator SlyA  33.87 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116497  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2560  transcriptional regulator SlyA  33.87 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  32.33 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2658  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 169 aa  70.5  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563591  normal  0.690586 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2214  transcriptional regulator SlyA  33.33 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559997  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2666  transcriptional regulator SlyA  36.36 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  36.89 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0096  MarR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2677  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2382  transcriptional regulator SlyA  36.36 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00066282  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  39.16 
 
 		 158 aa  67  0.00000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  37.7 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  36.61 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1469  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  42 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  31.97 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1722  transcriptional regulator SlyA  35.9 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00118206  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  32.26 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  32.26 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3435  MarR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0516  MarR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.716514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  32.26 
 
 		 146 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1689  transcriptional regulator SlyA  35.45 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 155 aa  63.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  35.24 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  32.26 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3395  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  32.26 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  34.55 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3610  MarR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4007  transcriptional regulator, MarR family  37.59 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.063729 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4021  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0620  MarR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3360  transcriptional regulator, MarR family  34.71 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4167  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3804  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279751  hitchhiker  0.00000113316 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4515  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934068  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  29.77 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0200  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.834737 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  29.01 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  33.61 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3772  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0569  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0564  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0540  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0409  MarR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.616987  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5052  MarR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>