More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_A0409 on replicon NC_009504
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009504  BOV_A0409  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
162 aa  321  3e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.616987  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3395  MarR family transcriptional regulator  77.7 
 
 
152 aa  198  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3482  MarR family transcriptional regulator  61.15 
 
 
171 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  43.57 
 
 
145 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  41.96 
 
 
191 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  40.85 
 
 
150 aa  107  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
177 aa  104  6e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  39.26 
 
 
141 aa  94.7  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1469  MarR family transcriptional regulator  38.97 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32790  Transcriptional regulator MarR family protein  39.57 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  37.98 
 
 
148 aa  80.1  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
159 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  42.61 
 
 
144 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  39.84 
 
 
143 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  42.61 
 
 
144 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3804  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
145 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279751  hitchhiker  0.00000113316 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  36.03 
 
 
142 aa  77.8  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
144 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  36.76 
 
 
144 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1396  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4515  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934068  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4021  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  32.33 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0135  MarR family transcriptional regulator  37.98 
 
 
157 aa  72  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0405255  normal  0.71696 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 
145 aa  72  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  35.11 
 
 
146 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 
146 aa  71.2  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  35.11 
 
 
146 aa  71.2  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  35.11 
 
 
146 aa  71.2  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  36.8 
 
 
146 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  36.89 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  38.79 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  38.79 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  38.79 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  38.79 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  38.79 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  38.79 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  34.35 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  34.35 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3617  transcriptional regulator, MarR family  33.79 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3704  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2214  transcriptional regulator SlyA  38.26 
 
 
144 aa  67  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559997  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  38.93 
 
 
157 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  33.88 
 
 
174 aa  67  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
145 aa  67  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  34.11 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  37.93 
 
 
144 aa  67  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1767  transcriptional regulator SlyA  38.14 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000697661  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1876  transcriptional regulator SlyA  38.14 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116497  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  35.65 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2560  transcriptional regulator SlyA  38.14 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673945  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2407  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445055  normal  0.878491 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0200  MarR family transcriptional regulator  34.97 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.834737 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0196  MarR family transcriptional regulator  36.15 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149236  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5052  MarR family transcriptional regulator  34.27 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  35.2 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
164 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0175  MarR family transcriptional regulator  36.15 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1807  transcriptional regulator, MarR family  35.38 
 
 
163 aa  63.2  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
164 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
163 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2677  MarR family transcriptional regulator  44.58 
 
 
153 aa  62.4  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6147  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
159 aa  62  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.676081  normal  0.847722 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
163 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
163 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
163 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  39.32 
 
 
153 aa  61.6  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5812  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
159 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697265  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6176  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
159 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.714929  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
165 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
165 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
165 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
165 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
165 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
165 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
165 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3377  regulatory protein, MarR  32.41 
 
 
150 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0974589  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  31.25 
 
 
149 aa  60.8  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
146 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
146 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2658  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
169 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563591  normal  0.690586 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6622  transcriptional regulator, MarR family  43.02 
 
 
158 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  38.68 
 
 
146 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5688  transcriptional regulator  36.51 
 
 
154 aa  60.5  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0170  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  38.68 
 
 
146 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6656  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
180 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2611  MarR family transcriptional regulator  43.02 
 
 
202 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1689  transcriptional regulator SlyA  37.27 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
146 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 
154 aa  58.9  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  36.45 
 
 
180 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.703331 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>