More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_22260 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  423  1e-118  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1920  transcriptional regulator, MarR family  44.83 
 
 		 233 aa  96.3  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.845679 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3151  transcriptional regulator, MarR family  38.93 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.355975  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  44.86 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0324  transcriptional regulator, MarR family  38.6 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  38.33 
 
 		 292 aa  78.2  0.00000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  34.51 
 
 		 161 aa  74.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  33.08 
 
 		 174 aa  67  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  30.28 
 
 		 139 aa  63.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  31.13 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  60.5  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 142 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0453  transcriptional regulator  33.61 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000992665  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1346  transcriptional regulator  31.86 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.564639  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  28.3 
 
 		 145 aa  60.5  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1425  transcriptional regulator, MarR family  35.2 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000183879  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3071  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.611663  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2467  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3152  hypothetical protein  32.14 
 
 		 284 aa  58.5  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0883  transcriptional regulator, MarR family  34.17 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.736004  normal  0.090725 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4115  transcriptional regulator, MarR family  29.77 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3076  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 142 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371862  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 162 aa  57.8  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 164 aa  57.4  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  29.63 
 
 		 153 aa  57.4  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1908  MarR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 163 aa  57.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4187  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 158 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2205  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 142 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00450336  hitchhiker  0.0000000000000144268 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  35.58 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 154 aa  57  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3045  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 142 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6338  transcriptional regulator, MarR family  28.85 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1458  regulatory protein  31.73 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4913  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.582328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 165 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 167 aa  54.3  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  30.65 
 
 		 138 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1375  MarR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 163 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 170 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0020  transcriptional regulator, MarR family  34.35 
 
 		 156 aa  53.1  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.275315  normal  0.608175 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2794  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 157 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0638  transcriptional regulator, MarR family  40.91 
 
 		 169 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.16424 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  32.98 
 
 		 146 aa  52.8  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3793  transcriptional regulator MarR family  26.4 
 
 		 180 aa  52.8  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0743996  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3512  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 156 aa  52.8  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 147 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2770  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 148 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  34.04 
 
 		 174 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2132  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 148 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.151362  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2744  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 148 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  34.12 
 
 		 170 aa  52  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1620  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 140 aa  52  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664296  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 		 170 aa  52  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1523  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 176 aa  51.6  0.000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.7127  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0555  MarR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 148 aa  51.6  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.519349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 146 aa  51.2  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 152 aa  51.2  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4023  MarR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 145 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  27.43 
 
 		 177 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 146 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3544  general secretion pathway protein G  43.75 
 
 		 140 aa  51.2  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000274638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 146 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 152 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 146 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2661  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 148 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0983  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 159 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0174  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 144 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.63734  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0841  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0989583  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0832  MarR family regulatory protein  35.92 
 
 		 144 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 150 aa  50.1  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0863  transcriptional regulator, TrmB  36.76 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029609 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2385  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 144 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  29.82 
 
 		 154 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0670  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 144 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 146 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2774  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 144 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2305  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 144 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.885566  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0654  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 144 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.536381  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 165 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 150 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4897  transcriptional regulator, MarR family  35.94 
 
 		 151 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3271  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 155 aa  49.3  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0542  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 144 aa  49.3  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 184 aa  49.3  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  27.86 
 
 		 173 aa  49.3  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 149 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6072  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 148 aa  48.9  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>