More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0517 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 161 aa  326  8e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  68.94 
 
 		 160 aa  226  9e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  65.22 
 
 		 159 aa  213  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  57.69 
 
 		 162 aa  185  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 182 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 153 aa  104  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 174 aa  93.2  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  39.23 
 
 		 154 aa  92.8  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 160 aa  92.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  39.23 
 
 		 154 aa  92.8  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 146 aa  85.1  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 146 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 146 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 146 aa  85.1  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 146 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0096  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2677  MarR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3908  transcriptional regulator, TrmB  34.53 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 141 aa  72  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  30.6 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 148 aa  67  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2105  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000763901  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3794  transcriptional regulator  32.41 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6318  transcriptional regulator, MarR family  29.37 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  28.67 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  34.01 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32790  Transcriptional regulator MarR family protein  32.79 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0135  MarR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0405255  normal  0.71696 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 145 aa  62  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2658  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563591  normal  0.690586 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 191 aa  60.8  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  28.57 
 
 		 139 aa  60.5  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0811  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.770437  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  28.78 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  33.59 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  29.06 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1458  regulatory protein  31.97 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3482  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3360  transcriptional regulator, MarR family  28.36 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  28.24 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  26.28 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3012  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 139 aa  57  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135712  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1928  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 138 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.428879 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  23.53 
 
 		 144 aa  57  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 160 aa  57  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  26.87 
 
 		 140 aa  57  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1738  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3308  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3099  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.634884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3085  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.729277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2996  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000177119  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2382  transcriptional regulator SlyA  27.13 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00066282  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3344  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  30.97 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  27.13 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3304  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3314  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3321  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  27.13 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  29.52 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  29.93 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1199  regulatory protein MarR  29.31 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2666  transcriptional regulator SlyA  27.13 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1469  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  27.13 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  27.13 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  37.33 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  27.13 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>