More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2127 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 145 aa  302  1.0000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2746  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477322  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3592  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1224  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414695  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5772  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  36.46 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  33.06 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  33.06 
 
 		 157 aa  67  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  36.46 
 
 		 150 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  35.42 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  35.42 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4527  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  34.58 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1041  regulatory protein, MarR  32.46 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610773  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  35.42 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  34.38 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  36.46 
 
 		 161 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0938  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 165 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00631452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 153 aa  63.5  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  34.69 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0133  regulatory protein MarR  38.46 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 167 aa  62  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  29.84 
 
 		 157 aa  62  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  35.42 
 
 		 161 aa  62  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  35.42 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 203 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6224  transcriptional regulator, MarR family  27.48 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1526  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3930  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 143 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627094  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4436  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 143 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  33.91 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2751  transcriptional regulator, MarR family  34.41 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.290738  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  32.67 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4708  transcriptional regulator, MarR family  31.87 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.155133  decreased coverage  0.00302291 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  31.45 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3631  transcriptional regulator, MarR family  31.87 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  33.91 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0803  transcriptional regulator, MarR family protein  34 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  32.86 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0515  transcriptional regulator, MarR family  27.59 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.628679  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  33.33 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5869  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.263359 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1979  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.293759  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4752  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0630735  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03706  transcription regulator protein  26.77 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.344298  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2005  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  31.68 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2611  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000285169  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7207  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4585  regulatory protein MarR  32.69 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0290  transcriptional regulator, MarR family protein  32.2 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0172  transcriptional regulator, MarR family protein  32.2 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  24.63 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0421  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0670441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2133  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  36.78 
 
 		 167 aa  57  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  32.65 
 
 		 163 aa  57  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3868  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 143 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.334531 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4328  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 143 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>