More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1834 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  100 
 
 		 144 aa  285  1e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  99.31 
 
 		 144 aa  281  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  99.31 
 
 		 144 aa  281  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  99.31 
 
 		 144 aa  281  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  99.31 
 
 		 144 aa  281  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  99.31 
 
 		 144 aa  281  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  99.31 
 
 		 144 aa  281  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  98.61 
 
 		 146 aa  280  6.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  98.61 
 
 		 144 aa  278  1e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  90.14 
 
 		 146 aa  253  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  90.14 
 
 		 146 aa  253  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  89.44 
 
 		 146 aa  251  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  88.73 
 
 		 146 aa  250  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  88.73 
 
 		 146 aa  250  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  86.71 
 
 		 146 aa  246  7e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  77.08 
 
 		 144 aa  223  6e-58  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2214  transcriptional regulator SlyA  76.22 
 
 		 144 aa  221  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559997  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2560  transcriptional regulator SlyA  76.22 
 
 		 143 aa  218  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1876  transcriptional regulator SlyA  76.22 
 
 		 143 aa  218  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116497  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1767  transcriptional regulator SlyA  76.22 
 
 		 143 aa  218  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000697661  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1722  transcriptional regulator SlyA  75 
 
 		 145 aa  213  8e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00118206  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2666  transcriptional regulator SlyA  73.05 
 
 		 145 aa  212  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1689  transcriptional regulator SlyA  74.47 
 
 		 145 aa  211  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2382  transcriptional regulator SlyA  73.05 
 
 		 145 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00066282  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  47.22 
 
 		 149 aa  141  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 156 aa  100  9e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4021  MarR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 145 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  40.98 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1396  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 145 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4515  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 145 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3804  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 145 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279751  hitchhiker  0.00000113316 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  40.98 
 
 		 144 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3435  MarR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 158 aa  97.1  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0516  MarR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 158 aa  97.1  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.716514  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4052  MarR family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 157 aa  95.5  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3610  MarR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 158 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 143 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 160 aa  94.4  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 141 aa  94.4  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0620  MarR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 168 aa  94  7e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3772  MarR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 157 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0569  transcriptional regulator, MarR family  41.48 
 
 		 157 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0540  MarR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 157 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0564  MarR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 157 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1782  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32790  Transcriptional regulator MarR family protein  41.46 
 
 		 148 aa  92  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1469  MarR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1921  MarR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 155 aa  92  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3252  transcriptional regulator, MarR family protein  41.35 
 
 		 161 aa  92  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  40.44 
 
 		 144 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 144 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 148 aa  90.5  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000535  putative transcription regulator  35.29 
 
 		 151 aa  90.5  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  37.3 
 
 		 146 aa  85.1  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  38.26 
 
 		 155 aa  84  7e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5688  transcriptional regulator  35.51 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0504  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  32.28 
 
 		 147 aa  76.6  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  32.28 
 
 		 147 aa  76.6  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1807  transcriptional regulator, MarR family  32.33 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  38.61 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2070  transcriptional regulator MarR  30.94 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317078 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3395  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  34.81 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  34.81 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0359  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000080599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 		 149 aa  72  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3360  transcriptional regulator, MarR family  31.01 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  33.83 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0170  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  43.82 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  33.88 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0661  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4167  MarR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0409  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 162 aa  67  0.00000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.616987  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03534  transcriptional regulator for cryptic hemolysin  33.33 
 
 		 210 aa  66.6  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3617  transcriptional regulator, MarR family  33.05 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3482  MarR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0200  MarR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.834737 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3377  regulatory protein, MarR  31.75 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0974589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6622  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3512  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3581  MarR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>