More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1130 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 148 aa  301  3.0000000000000004e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  45.39 
 
 		 141 aa  136  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  47.52 
 
 		 143 aa  133  9e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  45.93 
 
 		 140 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 145 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  40.43 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 141 aa  101  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 156 aa  99.8  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 139 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  35.94 
 
 		 139 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  36.72 
 
 		 139 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 139 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 139 aa  94.7  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  35.94 
 
 		 139 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 139 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 157 aa  93.6  8e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1287  MarR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 168 aa  93.2  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 138 aa  93.2  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 138 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 138 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 138 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  37.98 
 
 		 138 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 150 aa  90.1  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 147 aa  90.1  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 139 aa  89  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 143 aa  88.6  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 143 aa  88.6  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 143 aa  88.2  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2640  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 154 aa  87.4  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 146 aa  85.1  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 142 aa  84.7  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 144 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1552  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  32.37 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  35.82 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2006  regulatory protein, MarR  38.24 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 168 aa  80.9  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  35.66 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  31.88 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6318  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1907  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3893  transcriptional regulator, MarR family  31.69 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.12829  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4622  MarR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 174 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0259  transcriptional regulator, MarR family  32.86 
 
 		 171 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623858  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 171 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  31.71 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2058  MarR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000115689  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0811  transcriptional regulator, MarR family  33.88 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.770437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  30.6 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  30.6 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  34.95 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  32.19 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  32.19 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  33.09 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  33.09 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  32.19 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  32.19 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  33.9 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  32.19 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  33.09 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  31.06 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  33.09 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 161 aa  70.5  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  33.09 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 141 aa  70.1  0.000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  31.51 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  35.64 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  31.06 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2782  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00307717  normal  0.0921189 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20780  transcriptional regulator, MarR family  33.1 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4961  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0717313  normal  0.154952 
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  33.05 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  32.2 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  34.26 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6436  transcriptional regulator, MarR family  33.93 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.408457 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0969  transcriptional regulator, MarR family  35.25 
 
 		 171 aa  68.6  0.00000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000635233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1537  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510368  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>