More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2058 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2058  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 159 aa  322  1e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000115689  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5723  transcriptional regulator, MarR family  49.66 
 
 		 150 aa  147  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5307  transcriptional regulator, MarR family  40.15 
 
 		 178 aa  108  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  29.5 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 148 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  31.21 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2624  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 166 aa  67  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000470188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4529  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 166 aa  67  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000513075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1341  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 173 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2455  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  32.69 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  41.86 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2273  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1552  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6171  Transcriptional regulators-like protein  30.25 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1578  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0267314 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  33.63 
 
 		 166 aa  62  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  31.37 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0369  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  24.63 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 139 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  24.63 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  24.63 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4622  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1517  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal  0.0147514 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1584  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.119163  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  29.23 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5157  transcriptional regulator, MarR family  28.36 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14169  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2167  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  31.3 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  41.98 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  28.47 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1907  MarR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4459  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777339 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1014  regulatory protein, MarR  29.25 
 
 		 170 aa  57.4  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.137304  normal  0.145225 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  26.9 
 
 		 178 aa  57.4  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  27.41 
 
 		 140 aa  57  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4010  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 168 aa  57  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.898778  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2006  regulatory protein, MarR  29.03 
 
 		 138 aa  57  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 143 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  31.82 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  26.89 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3392  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284351 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  31.07 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  30.1 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  28.18 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  32.76 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0797  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2695  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.21037  hitchhiker  0.0000565476 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0549  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  30.09 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  32.76 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>