More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1531 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 141 aa  278  3e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 142 aa  150  5.9999999999999996e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 143 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 143 aa  128  3e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  42.42 
 
 		 145 aa  113  7.999999999999999e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  38.93 
 
 		 154 aa  89.7  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  36.92 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  26.96 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3404  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  39.56 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  28.79 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 		 171 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  25.86 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  30.77 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1696  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0158  transcriptional regulator, MarR family  25.58 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  31.87 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4318  MarR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  40.45 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  28.99 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  27.13 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2079  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.742687 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  33 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  25.58 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  27.93 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 185 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  26.83 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  30.41 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2101  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0043362  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2462  MarR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0843644  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2084  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 155 aa  57  0.00000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1251  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4520  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  40.54 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  24.11 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0840  regulatory protein, MarR  28.57 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  27.68 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0796  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.517671  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2221  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014883  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2182  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.242743  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2058  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000115689  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2527  transcriptional regulator, MarR family  27.88 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000236646  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1718  transcriptional regulator, MarR family  31.52 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  30.1 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>