More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2958 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 155 aa  320  5e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  57.79 
 
 		 155 aa  181  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  34.11 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  35.66 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  35.66 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  33.07 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  35.38 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  29.32 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 161 aa  70.5  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  27.97 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 136 aa  70.1  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  27.59 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  33.9 
 
 		 157 aa  67  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  41.49 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5540  transcriptional regulator, MarR family  33.66 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.971707 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  30.08 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  40.43 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2133  MarR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  28.91 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4585  regulatory protein MarR  36.63 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  40.43 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  40.87 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1620  MarR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664296  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  38.6 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0133  regulatory protein MarR  49.32 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  40.43 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  40.23 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3597  MarR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  36.15 
 
 		 155 aa  63.5  0.0000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  25.76 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2828  regulatory protein MarR  26.92 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2750  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.395044  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4622  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  33.83 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6917  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2751  transcriptional regulator, MarR family  32.31 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.290738  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  37.72 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1151  transcriptional regulator, TrmB  36.79 
 
 		 162 aa  62  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0421  MarR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0670441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  36.27 
 
 		 162 aa  62  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  44 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  38.3 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  30.36 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2923  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 176 aa  60.8  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 180 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0803  transcriptional regulator, MarR family protein  35.71 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 185 aa  60.8  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2456  transcriptional regulator, MarR family  37.11 
 
 		 168 aa  60.5  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  34.95 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  34.95 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  31.19 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  40.43 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  34.95 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  34.95 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>