More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1893 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  100 
 
 		 172 aa  345  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  86.63 
 
 		 171 aa  279  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  80.81 
 
 		 172 aa  273  8e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  70.91 
 
 		 170 aa  236  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  42.14 
 
 		 178 aa  108  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 193 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  40.62 
 
 		 161 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 		 171 aa  104  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  39.49 
 
 		 156 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 156 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 167 aa  99.8  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 167 aa  96.7  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  36.13 
 
 		 157 aa  96.7  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 159 aa  97.1  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  36.24 
 
 		 172 aa  97.1  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  41.73 
 
 		 158 aa  95.5  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 156 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 154 aa  94  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 197 aa  92.8  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1134  MarR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 154 aa  90.5  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  hitchhiker  0.0000997239 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  38.69 
 
 		 161 aa  89.4  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  37.58 
 
 		 161 aa  89.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 151 aa  87.4  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2729  regulatory protein, MarR  36.84 
 
 		 162 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 169 aa  82.4  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2945  transcriptional regulator, MarR family  36.09 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521959  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  40.19 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1381  MarR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421757  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3027  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 163 aa  77.4  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  39.85 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0986  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  32.31 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0795  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03946  transcriptional regulator MarR family  40.83 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.828616  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 303 aa  70.9  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  32.72 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3044  MarR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0803  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 157 aa  67  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  32.17 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0666  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  33.83 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3480  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0245944  normal  0.530872 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 170 aa  62  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 138 aa  62  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  34.07 
 
 		 287 aa  61.6  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  39.64 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2317  MarR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  33.56 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  33.33 
 
 		 177 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0021  MarR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 181 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  39.22 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  37.78 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  33.68 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1722  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 183 aa  57.4  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  33.62 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 315 aa  57.4  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 139 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 178 aa  57  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 139 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  28.42 
 
 		 139 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 139 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 175 aa  57  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  28.42 
 
 		 139 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  28.42 
 
 		 139 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  42.68 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  31.82 
 
 		 292 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0661  transcriptional regulator, MarR family  32.28 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>