More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0565 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 193 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  59.86 
 
 		 171 aa  187  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  59.86 
 
 		 171 aa  187  7e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  58.5 
 
 		 178 aa  178  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  40 
 
 		 172 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  39.58 
 
 		 172 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0795  MarR family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 179 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 170 aa  101  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3027  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 163 aa  98.2  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  40.98 
 
 		 158 aa  87.8  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  35.61 
 
 		 161 aa  86.7  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  35.07 
 
 		 156 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 156 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2729  regulatory protein, MarR  35.61 
 
 		 162 aa  87  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 156 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2945  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 162 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521959  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1134  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 154 aa  84.3  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  hitchhiker  0.0000997239 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 197 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  30.34 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  31.29 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 166 aa  78.6  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  34.03 
 
 		 169 aa  77.4  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 154 aa  77.8  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  28.22 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  40 
 
 		 157 aa  74.3  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 167 aa  73.9  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0803  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 		 163 aa  70.9  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1722  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  32.33 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0666  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1381  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421757  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  33.33 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3044  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 138 aa  62  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  33.06 
 
 		 157 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 143 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 142 aa  60.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 168 aa  60.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04625  transcriptional regulator MarR family  33.59 
 
 		 157 aa  60.8  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 153 aa  60.5  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  32.03 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  28.79 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 161 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3184  transcriptional regulator, MarR family  36.59 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.824605 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  26.95 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3480  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0245944  normal  0.530872 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  26.95 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  31.16 
 
 		 287 aa  58.2  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4972  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  27.01 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  30.07 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 150 aa  57.8  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 137 aa  57  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2016  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 167 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2241  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  36.89 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2013  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  36.21 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4913  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.582328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  34.33 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0131  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  34.51 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  29.84 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 185 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>