More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0803 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0803  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 157 aa  320  5e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  44.52 
 
 		 161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  45.65 
 
 		 161 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  43.07 
 
 		 172 aa  108  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1722  MarR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 170 aa  70.9  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  29.57 
 
 		 158 aa  70.5  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  28.08 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  29.66 
 
 		 172 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 166 aa  67  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3027  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5296  transcriptional regulator MarR family  25.18 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3480  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0245944  normal  0.530872 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  31.76 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1134  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  hitchhiker  0.0000997239 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  35.11 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3454  MarR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.947902  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 168 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 171 aa  60.8  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  27.01 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2729  regulatory protein, MarR  24.26 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2945  transcriptional regulator, MarR family  24.26 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521959  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2016  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 167 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 161 aa  57  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3044  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 165 aa  57  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1381  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421757  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  27.22 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0934  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213342  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3365  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.559351  normal  0.177926 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  31.03 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 184 aa  54.3  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5695  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02203  transcription regulator transcription regulator protein  28.21 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  28.47 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 195 aa  53.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  27.34 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  29.2 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 172 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 193 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  32.63 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4923  transcriptional regulator, MarR family  30.93 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3846  transcriptional regulator, MarR family  30.93 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.530483 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4463  hypothetical protein  30.39 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  25.87 
 
 		 163 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  34.04 
 
 		 147 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 		 158 aa  50.8  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 143 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 167 aa  50.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 165 aa  50.4  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  27.43 
 
 		 150 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 165 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 201 aa  50.4  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 153 aa  50.4  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  29.75 
 
 		 168 aa  50.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 170 aa  50.4  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  27.43 
 
 		 151 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7500  hypothetical protein  29.52 
 
 		 190 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3441  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 174 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1089  MarR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 184 aa  50.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  29.59 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7490  hypothetical protein  29.52 
 
 		 190 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2013  transcriptional regulator, MarR family  32.32 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  27.93 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 146 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>