More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1989 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 164 aa  319  9.000000000000001e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 159 aa  104  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  39.86 
 
 		 154 aa  94.4  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 160 aa  93.6  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 		 154 aa  91.7  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0096  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 146 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  36.5 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  35.92 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  35.92 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  35.92 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  35.92 
 
 		 146 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  35.92 
 
 		 146 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 182 aa  72  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2214  transcriptional regulator SlyA  37.41 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559997  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  35.51 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  39.1 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  39.1 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 159 aa  70.5  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  39.45 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1199  regulatory protein MarR  32.17 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  35.51 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  35.07 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1876  transcriptional regulator SlyA  34.29 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116497  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1767  transcriptional regulator SlyA  34.29 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000697661  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2560  transcriptional regulator SlyA  34.29 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  32.68 
 
 		 161 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2382  transcriptional regulator SlyA  35.66 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00066282  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2666  transcriptional regulator SlyA  35.66 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  34.06 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  34.06 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  34.06 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  34.06 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  34.06 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  34.06 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5688  transcriptional regulator  38.79 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  34.06 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  34.06 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1722  transcriptional regulator SlyA  35.92 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00118206  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1689  transcriptional regulator SlyA  35.92 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  35.82 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  33.33 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1469  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4021  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  30.37 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  42.68 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4515  MarR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934068  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1396  MarR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  63.27 
 
 		 157 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  42.39 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  31.88 
 
 		 142 aa  60.5  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  36.54 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  34.01 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5035  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3804  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279751  hitchhiker  0.00000113316 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157721  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32790  Transcriptional regulator MarR family protein  33.33 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2773  transcriptional regulator, MarR family  34.75 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  44.68 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  32.35 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3794  transcriptional regulator  36.5 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>