More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2762 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 184 aa  366  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03946  transcriptional regulator MarR family  47.45 
 
 		 143 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.828616  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 166 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 155 aa  97.8  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 151 aa  97.8  8e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 151 aa  96.3  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 146 aa  96.7  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 197 aa  92.4  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  41.61 
 
 		 163 aa  91.7  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 167 aa  84.7  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  32.64 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0986  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  32.64 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  30.07 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  30.07 
 
 		 171 aa  74.7  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 170 aa  73.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  39.6 
 
 		 158 aa  73.9  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 154 aa  73.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  38.14 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  35.66 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  32.9 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  32.81 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  31.65 
 
 		 178 aa  71.2  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  35.85 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1381  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 146 aa  70.5  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421757  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1134  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  hitchhiker  0.0000997239 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  31.34 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3480  MarR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 147 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0245944  normal  0.530872 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  29.5 
 
 		 142 aa  67  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3027  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  28.48 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  28.78 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 156 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  29.85 
 
 		 161 aa  64.3  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  29.85 
 
 		 156 aa  64.3  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  30.37 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1876  transcriptional regulator, MarR family  33.81 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2729  regulatory protein, MarR  29.1 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  30.22 
 
 		 157 aa  62  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 158 aa  60.5  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 161 aa  60.5  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  34.51 
 
 		 153 aa  60.5  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0795  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 179 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2945  transcriptional regulator, MarR family  26.57 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521959  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3825  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2022  transcriptional regulator, MarR family  30.33 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1722  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  25.76 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  31.07 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2538  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474386  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  31.36 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2005  MarR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  34.55 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2738  transcriptional regulator, MarR family  28.21 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.708856 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 164 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  35.42 
 
 		 154 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2244  transcriptional regulator, MarR family  29.84 
 
 		 155 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 156 aa  57  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 161 aa  57  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0524  multidrug resistance operon repressor MexR  34.55 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4708  transcriptional regulator, MarR family  28.33 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.155133  decreased coverage  0.00302291 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  27.35 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0210  MarR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.133838 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3631  transcriptional regulator, MarR family  28.33 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  26.85 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0666  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3259  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0457343  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  27.59 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>