More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3989 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
158 aa  313  4e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  64.54 
 
 
152 aa  173  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  57.34 
 
 
144 aa  160  8.000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  58.73 
 
 
167 aa  154  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  56.62 
 
 
149 aa  151  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2538  transcriptional regulator, MarR family  59.09 
 
 
154 aa  147  8e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474386  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  50.36 
 
 
150 aa  130  9e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 
159 aa  128  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  51.77 
 
 
157 aa  125  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1929  transcriptional regulator, MarR family  46.38 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4592  transcriptional regulator, MarR family  54.86 
 
 
152 aa  110  9e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0409464  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3615  transcriptional regulator, MarR family  37.23 
 
 
158 aa  80.5  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210335  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  35.29 
 
 
151 aa  80.5  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0560  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
162 aa  77  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 
174 aa  74.3  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  38.05 
 
 
158 aa  71.2  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
172 aa  67.4  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  36.61 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
315 aa  66.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 
174 aa  65.1  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  38.02 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  38.54 
 
 
143 aa  64.3  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  41.76 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
158 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
158 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 
189 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
158 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
188 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 
180 aa  62  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003893  transcriptional regulator  28.91 
 
 
151 aa  61.2  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  42.53 
 
 
172 aa  61.6  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
151 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 
148 aa  60.8  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1950  transcriptional regulator, MarR family  36.52 
 
 
152 aa  60.8  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146852  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
194 aa  60.8  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6031  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 
159 aa  60.5  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01757  hypothetical protein  29.81 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  31.88 
 
 
164 aa  60.1  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  38.46 
 
 
145 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  32.71 
 
 
177 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 
151 aa  59.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  35.64 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 
176 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
158 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
172 aa  57.4  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
184 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  32.86 
 
 
169 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
205 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2082  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 
158 aa  57  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2823  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
148 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  29.84 
 
 
168 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2225  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
162 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
142 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
142 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
142 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 
152 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
160 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6003  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
244 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  37.37 
 
 
169 aa  55.5  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  39.74 
 
 
159 aa  55.1  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 
159 aa  55.1  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6941  transcriptional regulator, MarR family  35.77 
 
 
151 aa  55.1  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853349  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 
155 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  36.26 
 
 
161 aa  54.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  35.45 
 
 
164 aa  54.3  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  29.84 
 
 
161 aa  54.3  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
172 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  31.25 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2998  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
154 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.414929 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
161 aa  53.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1214  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 
162 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0962151 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
155 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
169 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 
153 aa  52.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9043  hypothetical protein  31.72 
 
 
159 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
173 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  30.07 
 
 
174 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 
161 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
149 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
158 aa  52.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
149 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3114  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
186 aa  52  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000547755 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
155 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 
160 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  23.39 
 
 
140 aa  52  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
149 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
149 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
149 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
149 aa  51.6  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  41.38 
 
 
161 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  28.99 
 
 
303 aa  51.6  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  37.5 
 
 
287 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 
195 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>