More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5487 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  100 
 
 		 169 aa  332  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  46.67 
 
 		 140 aa  105  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  46.49 
 
 		 145 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 142 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 142 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 142 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 142 aa  90.5  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6003  MarR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 244 aa  85.1  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 194 aa  84.3  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  42.11 
 
 		 164 aa  84  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  37.59 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2532  transcriptional regulator, MarR family  34.46 
 
 		 166 aa  77  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2764  transcriptional regulator, MarR family  37.84 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0619086  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  38.83 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06310  transcriptional regulator  39.6 
 
 		 169 aa  70.1  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2225  MarR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3834  transcriptional regulator, MarR family  38.06 
 
 		 175 aa  66.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9043  hypothetical protein  36.43 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  36.92 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1214  transcriptional regulator, MarR family  37.31 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0962151 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  38.35 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8231  transcriptional regulator, MarR family  41.24 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3088  transcriptional regulator, MarR family  34.92 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00891754  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  35.25 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  34.07 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03320  transcriptional regulator  30.66 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  31.36 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  37.76 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  31.36 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2084  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000746204  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3205  transcriptional regulator, MarR family  41.46 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000109713  hitchhiker  0.00541794 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  30.26 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  44.78 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2407  MarR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445055  normal  0.878491 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2713  transcriptional regulator, MarR family  34.13 
 
 		 196 aa  57  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  33.94 
 
 		 157 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 167 aa  57  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3159  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 164 aa  57  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  35.14 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3993  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.73498 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  43.21 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3825  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3512  MarR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1895  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 190 aa  54.3  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5379  Transcriptional regulators-like protein  29.73 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 193 aa  54.3  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1485  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.252569  normal  0.356309 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  38.82 
 
 		 158 aa  53.9  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3615  transcriptional regulator, MarR family  32.04 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  34.69 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5688  transcriptional regulator  49.25 
 
 		 154 aa  53.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  32.63 
 
 		 146 aa  53.1  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  33.03 
 
 		 157 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 233 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 165 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  33.03 
 
 		 157 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 149 aa  52.4  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  32 
 
 		 151 aa  52.8  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  52.4  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 135 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  27.73 
 
 		 144 aa  52  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 172 aa  52  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 303 aa  52  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  36.26 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2635  transcriptional regulator, MarR family  41.89 
 
 		 168 aa  52  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1961  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 143 aa  51.6  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2889  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 167 aa  51.2  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000416849 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 157 aa  51.2  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 146 aa  51.2  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 169 aa  50.8  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  35.71 
 
 		 168 aa  50.8  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2214  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.693341 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 145 aa  50.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  31.58 
 
 		 172 aa  50.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8732  hypothetical protein  38.75 
 
 		 139 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 150 aa  50.4  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 169 aa  50.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>