More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2929 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 315 aa  629  1e-179  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 174 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 170 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  37.86 
 
 		 150 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  37.86 
 
 		 151 aa  99.4  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 172 aa  97.1  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  34.27 
 
 		 177 aa  94  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  45.3 
 
 		 151 aa  93.2  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 172 aa  92.8  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 148 aa  91.3  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 159 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0934  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 303 aa  89.4  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 169 aa  87.8  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  33.81 
 
 		 176 aa  88.2  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 188 aa  87  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 161 aa  86.7  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 184 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 176 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 153 aa  84  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 178 aa  80.1  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 161 aa  80.5  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 175 aa  79.7  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5695  transcriptional regulator, MarR family  33.99 
 
 		 155 aa  75.1  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0279  MarR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 158 aa  74.7  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.468058  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 157 aa  75.1  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  32.33 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  37.01 
 
 		 140 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5689  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 150 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868849  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 151 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 142 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5123  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0421  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.799944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4590  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777081  normal  0.899831 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 172 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 149 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1281  MarR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 134 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.841925 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  37.61 
 
 		 140 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3125  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0374972  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5242  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5030  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942025 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  32.33 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 141 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  33.07 
 
 		 155 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  35.85 
 
 		 141 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 154 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 161 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  36.21 
 
 		 158 aa  61.2  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1683  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.857494 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3666  MarR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4036  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2885  MarR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311419  normal  0.195919 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3027  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 163 aa  58.5  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  38.79 
 
 		 172 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 174 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 171 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 137 aa  57.4  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 155 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  31.72 
 
 		 172 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1241  MarR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47580  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  28.38 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2731  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  26.39 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4105  putative transcriptional regulator  33.6 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727609  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 155 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  28.97 
 
 		 143 aa  55.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 152 aa  55.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2043  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 175 aa  55.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.831784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 170 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4414  transcriptional regulator, MarR family  28.04 
 
 		 140 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.552703 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 168 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  35.4 
 
 		 141 aa  54.3  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0734  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 140 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 160 aa  55.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4489  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 146 aa  54.3  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1623  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 145 aa  54.7  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0513961  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6031  transcriptional regulator, MarR family  32.28 
 
 		 159 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 195 aa  54.3  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 155 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1651  MarR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 134 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467491 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 		 149 aa  53.9  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 180 aa  53.5  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0283  transcriptional regulator, MarR family  32.88 
 
 		 157 aa  53.5  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.34751  hitchhiker  0.000254243 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2486  MarR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 148 aa  53.5  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0993114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 158 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>