More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2731 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2731  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 148 aa  296  8e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0480  MarR family transcriptional regulator  64.63 
 
 		 149 aa  190  7e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600273  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0418  MarR family regulatory protein  64.63 
 
 		 149 aa  190  7e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0815  transcriptional regulator, MarR family  65.97 
 
 		 171 aa  189  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134488  normal  0.259947 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0928  transcriptional regulator, MarR family  64.63 
 
 		 148 aa  189  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155001  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  58.5 
 
 		 155 aa  173  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  60 
 
 		 158 aa  173  8e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1623  MarR family transcriptional regulator  60.28 
 
 		 145 aa  172  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0513961  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  58.5 
 
 		 155 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  57.82 
 
 		 155 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  63.16 
 
 		 154 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  59.72 
 
 		 155 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4489  MarR family transcriptional regulator  59.31 
 
 		 146 aa  171  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  63.16 
 
 		 154 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3484  MarR family transcriptional regulator  64.63 
 
 		 150 aa  169  9e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.643399  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  56.94 
 
 		 155 aa  169  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2486  MarR family transcriptional regulator  61.9 
 
 		 148 aa  157  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0993114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2885  MarR family transcriptional regulator  60.14 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311419  normal  0.195919 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3666  MarR family transcriptional regulator  57.25 
 
 		 156 aa  140  6e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3683  transcriptional regulator, MarR family  61.07 
 
 		 153 aa  139  9e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  48.87 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1112  putative transcription regulator protein  61.98 
 
 		 139 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0169999  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  44.9 
 
 		 149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4517  MarR family transcriptional regulator  61.03 
 
 		 172 aa  127  7.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.045561  normal  0.882671 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  56.8 
 
 		 145 aa  123  8.000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3628  hypothetical protein  51.06 
 
 		 149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0952966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  46.27 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1281  MarR family transcriptional regulator  45.3 
 
 		 134 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.841925 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0914  transcriptional regulator, MarR family  43.97 
 
 		 156 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2789  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 		 156 aa  90.9  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.591127 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5489  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 154 aa  90.1  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4036  MarR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 134 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1241  MarR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 134 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1683  MarR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.857494 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1142  MarR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 153 aa  85.9  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4605  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3758  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715353  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 144 aa  84.3  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 142 aa  84  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3635  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2812  MarR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0746607  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2341  MarR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1760  MarR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 134 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0162725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4105  putative transcriptional regulator  39.53 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727609  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11067  transcriptional repressor  35.29 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.314337 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2003  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3155  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1651  MarR family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467491 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5550  transcriptional regulator, MarR family  37.69 
 
 		 175 aa  75.5  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4493  MarR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.118843  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1519  MarR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.713594  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1572  MarR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2350  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.196227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4492  MarR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257685  normal  0.150503 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4414  transcriptional regulator, MarR family  34.85 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.552703 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0734  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3996  transcriptional regulator protein  36.67 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0078  MarR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1595  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.714194  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47580  MarR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0804  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4972  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0735  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4415  transcriptional regulator, MarR family  33.86 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.75195  normal  0.537773 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0049  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 171 aa  68.6  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68738  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3519  MarR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0211  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 145 aa  67  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.739168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1346  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3544  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6446  transcriptional regulator, MarR family  36.22 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  36.15 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2670  regulatory protein MarR  33.33 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  37.62 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  32.48 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  27.93 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5260  MarR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229053 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2923  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3633  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2343  hypothetical protein  30.71 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3003  transcriptional regulator, MarR family  38.04 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5487  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.84256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0133  regulatory protein MarR  40.43 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0969  transcriptional regulator, MarR family  35.11 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000635233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  34.69 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  34.69 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1098  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>