125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6446 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6446  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 170 aa  332  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0886  transcriptional regulator, MarR family  63.45 
 
 		 179 aa  166  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5550  transcriptional regulator, MarR family  59.31 
 
 		 175 aa  164  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2350  MarR family transcriptional regulator  56.55 
 
 		 212 aa  154  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.196227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0049  MarR family transcriptional regulator  47.68 
 
 		 171 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68738  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  38.58 
 
 		 149 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0078  MarR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  38.58 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1346  MarR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  40.54 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4492  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257685  normal  0.150503 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0480  MarR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600273  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0418  MarR family regulatory protein  34.92 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2812  MarR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0746607  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2003  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4605  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3758  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715353  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3635  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0804  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2341  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11067  transcriptional repressor  37.8 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.314337 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4105  putative transcriptional regulator  35.94 
 
 		 137 aa  62  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727609  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5489  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2731  MarR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4071  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137556  normal  0.92805 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3155  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4414  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.552703 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3545  MarR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359326  normal  0.253547 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0734  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3519  MarR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47580  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0211  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.739168  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1572  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1519  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.713594  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2670  regulatory protein MarR  31.54 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3110  transcriptional regulator, MarR family  37.41 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4972  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2978  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1142  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5359  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.157923  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1241  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4493  MarR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 147 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.118843  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2923  MarR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1623  MarR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0513961  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4489  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0815  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134488  normal  0.259947 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3484  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.643399  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1697  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267182  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0928  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155001  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3003  transcriptional regulator, MarR family  38.85 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0735  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 138 aa  52.4  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  29.37 
 
 		 149 aa  52.8  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1595  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 133 aa  52.8  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.714194  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06310  transcriptional regulator  35.96 
 
 		 169 aa  52.4  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3628  hypothetical protein  33.64 
 
 		 149 aa  52  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0952966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4415  transcriptional regulator, MarR family  33.61 
 
 		 140 aa  52  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.75195  normal  0.537773 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2789  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 156 aa  51.6  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.591127 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2919  MarR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 142 aa  51.2  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0914  transcriptional regulator, MarR family  33.9 
 
 		 156 aa  51.2  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1683  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 134 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.857494 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4036  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 134 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3696  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1901  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.015299 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2486  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0993114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1281  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 134 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.841925 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1760  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 134 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0162725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2156  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 149 aa  47.8  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.309687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2885  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 156 aa  47.4  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311419  normal  0.195919 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3996  transcriptional regulator protein  27.82 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 139 aa  47.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3088  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00891754  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5017  MarR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.211295  normal  0.268474 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4974  MarR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 143 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.554489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3666  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1356  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1241  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0843  regulatory protein MarR  30.25 
 
 		 178 aa  45.4  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.852456  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2343  hypothetical protein  31.97 
 
 		 143 aa  45.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  30.1 
 
 		 153 aa  45.4  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3544  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 165 aa  44.7  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4115  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 146 aa  44.3  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1051  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 185 aa  44.3  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1067  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 185 aa  44.3  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.124538 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0089  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 138 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1079  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2285  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 138 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.864353  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3895  regulatory protein MarR  29.73 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3683  transcriptional regulator, MarR family  32.32 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>