More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1827 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 153 aa  310  6.999999999999999e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0078  MarR family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 138 aa  106  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3519  MarR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 163 aa  101  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4414  transcriptional regulator, MarR family  37.78 
 
 		 140 aa  98.2  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.552703 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0734  MarR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 140 aa  98.2  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1346  MarR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 155 aa  96.3  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 155 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4972  MarR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 142 aa  94  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0049  MarR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 171 aa  94  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68738  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 155 aa  93.6  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0211  MarR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.739168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4492  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 141 aa  90.9  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257685  normal  0.150503 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2812  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 137 aa  90.1  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0746607  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 158 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 155 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 155 aa  88.2  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 155 aa  87.8  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4605  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 142 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3758  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 142 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715353  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1623  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 145 aa  86.7  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0513961  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5489  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 154 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 142 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3635  MarR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0804  MarR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 140 aa  84.3  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47580  MarR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 149 aa  84  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1142  MarR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 153 aa  84  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2341  MarR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2003  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0914  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4105  putative transcriptional regulator  37.84 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727609  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11067  transcriptional repressor  39.13 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.314337 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0480  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600273  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0418  MarR family regulatory protein  34.38 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  42.06 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4489  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3155  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  42.06 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1519  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.713594  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1572  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0735  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4036  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4415  transcriptional regulator, MarR family  36.07 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.75195  normal  0.537773 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4493  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.118843  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0815  transcriptional regulator, MarR family  30.94 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134488  normal  0.259947 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1595  MarR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 133 aa  75.9  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.714194  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1683  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.857494 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6446  transcriptional regulator, MarR family  34.27 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2789  transcriptional regulator, MarR family  34.56 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.591127 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0928  transcriptional regulator, MarR family  31.21 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155001  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3110  transcriptional regulator, MarR family  38.76 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0886  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0350  MarR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 138 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1241  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2885  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311419  normal  0.195919 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0586  MarR family regulatory protein  35.77 
 
 		 164 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.7562  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1281  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.841925 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4974  MarR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.554489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1241  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3633  MarR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0865  transcriptional regulator, MarR family  32.59 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5487  MarR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.84256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0404  MarR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0144354  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1760  MarR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0162725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3683  transcriptional regulator, MarR family  37.17 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0424  MarR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.476244  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0089  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2003  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2285  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.864353  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3666  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2923  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3093  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3484  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.643399  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2731  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4607  regulatory protein, MarR  36.8 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3756  regulatory protein, MarR  36.8 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.203482  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1297  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  39.22 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4585  regulatory protein MarR  36.7 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3767  regulatory protein MarR  36 
 
 		 143 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.178096 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3003  transcriptional regulator, MarR family  38.14 
 
 		 142 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1651  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467491 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2343  hypothetical protein  36.8 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4071  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137556  normal  0.92805 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2919  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0969  transcriptional regulator, MarR family  33.66 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000635233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  37.11 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  31.48 
 
 		 162 aa  62  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  36 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 		 162 aa  62  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  31.53 
 
 		 163 aa  62  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5550  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 175 aa  61.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>