181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2923 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2923  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 158 aa  315  2e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1241  MarR family transcriptional regulator  65.52 
 
 		 151 aa  200  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1901  MarR family transcriptional regulator  60.42 
 
 		 168 aa  173  7e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.015299 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1697  MarR family transcriptional regulator  61.43 
 
 		 160 aa  171  5e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267182  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3545  MarR family transcriptional regulator  60.87 
 
 		 161 aa  168  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359326  normal  0.253547 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2978  MarR family transcriptional regulator  59.4 
 
 		 170 aa  160  6e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3696  transcriptional regulator, MarR family  57.78 
 
 		 151 aa  154  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5359  transcriptional regulator, MarR family  47.3 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.157923  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0078  MarR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 138 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4105  putative transcriptional regulator  45.59 
 
 		 137 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727609  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1346  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2812  MarR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 137 aa  89.7  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0746607  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1760  MarR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 134 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0162725  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1683  MarR family transcriptional regulator  45.3 
 
 		 134 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.857494 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47580  MarR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 149 aa  87.4  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4036  MarR family transcriptional regulator  45.3 
 
 		 134 aa  87.4  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1281  MarR family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.841925 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1241  MarR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0804  MarR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 140 aa  85.5  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0914  transcriptional regulator, MarR family  35.97 
 
 		 156 aa  84  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1651  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 134 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467491 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0049  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68738  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5178  MarR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.638261 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1142  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  34.59 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  34.72 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2670  regulatory protein MarR  38.79 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4605  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3758  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715353  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3003  transcriptional regulator, MarR family  48.94 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5489  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4415  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 140 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.75195  normal  0.537773 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2341  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3635  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0735  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2003  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3155  transcriptional regulator, MarR family  33.07 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  36.5 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3110  transcriptional regulator, MarR family  45.74 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5260  MarR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229053 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2919  MarR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0350  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 138 aa  67  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2789  transcriptional regulator, MarR family  32.52 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.591127 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0815  transcriptional regulator, MarR family  36.89 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134488  normal  0.259947 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1595  MarR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.714194  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5550  transcriptional regulator, MarR family  37.12 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0734  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0886  transcriptional regulator, MarR family  36.05 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1519  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.713594  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4414  transcriptional regulator, MarR family  31.45 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.552703 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0586  MarR family regulatory protein  36 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.7562  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1572  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0089  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3519  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4972  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3093  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2003  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0404  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0144354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0424  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.476244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2285  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.864353  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0092  transcriptional regulator, MarR family  27.7 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16300  transcriptional regulator, MarR family  45.1 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 158 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0480  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600273  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0418  MarR family regulatory protein  33.1 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4071  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137556  normal  0.92805 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0928  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155001  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4493  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.118843  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1623  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0513961  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2658  MarR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 169 aa  57  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563591  normal  0.690586 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4492  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257685  normal  0.150503 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6446  transcriptional regulator, MarR family  34.35 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11067  transcriptional repressor  32.8 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.314337 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  38.14 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2731  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1928  transcriptional regulator, MarR family  26.19 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.428879 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3308  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3099  MarR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.634884  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2996  MarR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000177119  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3344  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3012  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3321  transcriptional regulator, MarR family  26.19 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3314  transcriptional regulator, MarR family  26.19 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3484  MarR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.643399  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3304  transcriptional regulator, MarR family  26.19 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3085  MarR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.729277  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2105  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000763901  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1794  MarR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0211  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.739168  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>