169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2978 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2978  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 170 aa  344  3e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3545  MarR family transcriptional regulator  79.87 
 
 		 161 aa  254  4e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359326  normal  0.253547 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1697  MarR family transcriptional regulator  63.38 
 
 		 160 aa  184  5e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267182  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3696  transcriptional regulator, MarR family  61.59 
 
 		 151 aa  178  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1901  MarR family transcriptional regulator  57.82 
 
 		 168 aa  167  9e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.015299 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1241  MarR family transcriptional regulator  57.45 
 
 		 151 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2923  MarR family transcriptional regulator  59.4 
 
 		 158 aa  160  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5359  transcriptional regulator, MarR family  48.87 
 
 		 156 aa  131  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.157923  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1346  MarR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 155 aa  98.6  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4105  putative transcriptional regulator  43.31 
 
 		 137 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727609  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2812  MarR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 137 aa  90.9  8e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0746607  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47580  MarR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 149 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4415  transcriptional regulator, MarR family  38.84 
 
 		 140 aa  84.3  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.75195  normal  0.537773 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0735  MarR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1241  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2003  MarR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0804  MarR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 140 aa  77  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0049  MarR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 171 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68738  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0914  transcriptional regulator, MarR family  33.07 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1760  MarR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0162725  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1683  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 134 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.857494 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4036  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 134 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2670  regulatory protein MarR  38.05 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0078  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 138 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5550  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 		 175 aa  70.9  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4493  MarR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.118843  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1281  MarR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.841925 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2789  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.591127 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3155  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1651  MarR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467491 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16300  transcriptional regulator, MarR family  45.45 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4492  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257685  normal  0.150503 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0350  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4414  transcriptional regulator, MarR family  30.33 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.552703 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0734  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1142  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1572  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1519  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 136 aa  63.5  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.713594  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2341  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11067  transcriptional repressor  32.77 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.314337 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1595  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.714194  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4974  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.554489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5489  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0586  MarR family regulatory protein  31.71 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.7562  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5260  MarR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229053 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2343  hypothetical protein  32.14 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0424  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.476244  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3519  MarR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4605  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3758  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715353  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3635  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 142 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0089  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 138 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3633  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5487  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.84256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3093  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 138 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2003  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 138 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0404  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 138 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0144354  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2285  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 138 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.864353  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  30.43 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0815  transcriptional regulator, MarR family  32.48 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134488  normal  0.259947 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5178  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.638261 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0886  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6446  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4607  regulatory protein, MarR  30.36 
 
 		 143 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3756  regulatory protein, MarR  30.36 
 
 		 143 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.203482  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3767  regulatory protein MarR  29.82 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.178096 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0211  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 145 aa  57  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.739168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4972  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 142 aa  57  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229805  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0480  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600273  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3110  transcriptional regulator, MarR family  35.65 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0418  MarR family regulatory protein  30.71 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1297  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3666  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0092  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2350  MarR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.196227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3484  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 150 aa  53.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.643399  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4071  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 157 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137556  normal  0.92805 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 155 aa  52.4  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3683  transcriptional regulator, MarR family  38.64 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3003  transcriptional regulator, MarR family  37.36 
 
 		 142 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1623  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 145 aa  52  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0513961  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0928  transcriptional regulator, MarR family  29.51 
 
 		 148 aa  51.2  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155001  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 154 aa  51.6  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2919  MarR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 142 aa  51.6  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 154 aa  51.6  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 155 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 149 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2885  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 156 aa  49.3  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311419  normal  0.195919 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2156  MarR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.309687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4366  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 165 aa  48.9  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 		 161 aa  48.5  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 139 aa  48.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>