195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1901 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1901  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 168 aa  340  4e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.015299 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3545  MarR family transcriptional regulator  62.96 
 
 		 161 aa  172  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359326  normal  0.253547 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2923  MarR family transcriptional regulator  60.42 
 
 		 158 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1697  MarR family transcriptional regulator  63.43 
 
 		 160 aa  171  5e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267182  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2978  MarR family transcriptional regulator  57.43 
 
 		 170 aa  166  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3696  transcriptional regulator, MarR family  56.55 
 
 		 151 aa  164  8e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1241  MarR family transcriptional regulator  55.88 
 
 		 151 aa  155  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5359  transcriptional regulator, MarR family  53.08 
 
 		 156 aa  131  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.157923  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4105  putative transcriptional regulator  44.27 
 
 		 137 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727609  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47580  MarR family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 149 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1346  MarR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 155 aa  90.5  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2812  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 137 aa  89  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0746607  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1142  MarR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 153 aa  84.7  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0914  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0586  MarR family regulatory protein  34.56 
 
 		 164 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.7562  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0350  MarR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0424  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.476244  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0089  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3093  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2003  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0404  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0144354  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2285  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.864353  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0078  MarR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 138 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0735  MarR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 138 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1760  MarR family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 134 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0162725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4415  transcriptional regulator, MarR family  39.32 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.75195  normal  0.537773 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0049  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 171 aa  79  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68738  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4605  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3758  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715353  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3155  transcriptional regulator, MarR family  37.72 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0804  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1651  MarR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467491 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0734  MarR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5489  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1241  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4414  transcriptional regulator, MarR family  36.8 
 
 		 140 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.552703 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4493  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.118843  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1683  MarR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.857494 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2341  MarR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4972  MarR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  35.83 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4036  MarR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 134 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3635  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 142 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4492  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257685  normal  0.150503 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5550  transcriptional regulator, MarR family  34.59 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2670  regulatory protein MarR  35.59 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5260  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229053 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3519  MarR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1281  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.841925 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2789  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 156 aa  67  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.591127 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11067  transcriptional repressor  34.45 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.314337 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2003  MarR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16300  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5178  MarR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 160 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.638261 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3003  transcriptional regulator, MarR family  40.43 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  34.55 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1572  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1519  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.713594  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1595  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.714194  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4071  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137556  normal  0.92805 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1297  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0480  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600273  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0418  MarR family regulatory protein  31.4 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0815  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134488  normal  0.259947 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3110  transcriptional regulator, MarR family  38.3 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2919  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 142 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 153 aa  57.4  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0886  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0211  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.739168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0928  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155001  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4974  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 143 aa  52.8  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.554489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 155 aa  52  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.03 
 
 		 144 aa  51.6  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.03 
 
 		 144 aa  51.6  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.03 
 
 		 144 aa  51.6  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.03 
 
 		 144 aa  51.6  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.03 
 
 		 144 aa  51.6  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.03 
 
 		 144 aa  51.6  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  32.03 
 
 		 144 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 		 144 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 146 aa  51.2  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  32.03 
 
 		 144 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0092  transcriptional regulator, MarR family  23.08 
 
 		 147 aa  51.2  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6446  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 		 170 aa  51.2  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3484  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 150 aa  51.2  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.643399  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 155 aa  50.8  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 158 aa  50.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2350  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 212 aa  50.8  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.196227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3633  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  29.69 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5487  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.84256  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 		 147 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 		 147 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798685 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>