More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0815 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0815  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 171 aa  341  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134488  normal  0.259947 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0928  transcriptional regulator, MarR family  89.19 
 
 		 148 aa  268  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155001  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0480  MarR family transcriptional regulator  74.32 
 
 		 149 aa  220  9e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600273  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0418  MarR family regulatory protein  74.32 
 
 		 149 aa  220  9e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3484  MarR family transcriptional regulator  74.67 
 
 		 150 aa  213  9e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.643399  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2731  MarR family transcriptional regulator  65.97 
 
 		 148 aa  188  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  62.16 
 
 		 155 aa  189  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1623  MarR family transcriptional regulator  63.19 
 
 		 145 aa  188  4e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0513961  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  61.74 
 
 		 155 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  61.49 
 
 		 155 aa  187  9e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  59.73 
 
 		 155 aa  185  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4489  MarR family transcriptional regulator  63.83 
 
 		 146 aa  183  9e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  62.68 
 
 		 158 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  58.39 
 
 		 155 aa  181  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2486  MarR family transcriptional regulator  62.16 
 
 		 148 aa  167  7e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0993114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2885  MarR family transcriptional regulator  65.71 
 
 		 156 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311419  normal  0.195919 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3683  transcriptional regulator, MarR family  60.53 
 
 		 153 aa  158  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3666  MarR family transcriptional regulator  61.7 
 
 		 156 aa  158  4e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  56.82 
 
 		 154 aa  147  7e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  56.82 
 
 		 154 aa  147  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4517  MarR family transcriptional regulator  61.33 
 
 		 172 aa  145  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.045561  normal  0.882671 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  62.81 
 
 		 145 aa  142  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3628  hypothetical protein  55.7 
 
 		 149 aa  139  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0952966  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1112  putative transcription regulator protein  58.2 
 
 		 139 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0169999  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  41.61 
 
 		 149 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  43.28 
 
 		 149 aa  111  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  47.75 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2789  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 156 aa  98.2  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.591127 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0914  transcriptional regulator, MarR family  43.27 
 
 		 156 aa  94.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 144 aa  93.2  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1142  MarR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 153 aa  90.1  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5489  MarR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 154 aa  86.3  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4605  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 142 aa  84.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3758  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 142 aa  84.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715353  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11067  transcriptional repressor  37.59 
 
 		 148 aa  84.3  8e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.314337 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4105  putative transcriptional regulator  37.93 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727609  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2003  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 144 aa  80.5  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2341  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3635  MarR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0078  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 138 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3519  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 163 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1241  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 134 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0734  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 140 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2812  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0746607  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0804  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1281  MarR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.841925 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47580  MarR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4972  MarR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4414  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.552703 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1683  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 134 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.857494 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1346  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 155 aa  73.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0049  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68738  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4036  MarR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3544  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3155  transcriptional regulator, MarR family  29.92 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4493  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.118843  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4492  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257685  normal  0.150503 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3996  transcriptional regulator protein  32.5 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4415  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.75195  normal  0.537773 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2350  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.196227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0735  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5550  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 		 175 aa  68.2  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2923  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1241  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1760  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0162725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3633  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5487  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.84256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1519  MarR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.713594  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1651  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467491 
 
 
-
 
NC_004310  BR1572  MarR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 219 aa  62  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 200 aa  62  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2343  hypothetical protein  29.32 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1595  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.714194  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0089  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0586  MarR family regulatory protein  35.24 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.7562  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0886  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2285  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.864353  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3093  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2003  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0404  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0144354  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16300  transcriptional regulator, MarR family  36.73 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0424  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.476244  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0211  MarR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.739168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0350  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3696  transcriptional regulator, MarR family  32.09 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  32.23 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2978  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4607  regulatory protein, MarR  29.32 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>