More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5112 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
155 aa  308  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  86.45 
 
 
155 aa  271  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  86.36 
 
 
155 aa  266  7e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  84.18 
 
 
158 aa  264  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  85.06 
 
 
155 aa  263  5e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  83.12 
 
 
155 aa  259  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0480  MarR family transcriptional regulator  65.77 
 
 
149 aa  191  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600273  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0418  MarR family regulatory protein  65.77 
 
 
149 aa  191  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0815  transcriptional regulator, MarR family  61.74 
 
 
171 aa  187  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134488  normal  0.259947 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0928  transcriptional regulator, MarR family  61.49 
 
 
148 aa  183  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155001  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1623  MarR family transcriptional regulator  64.08 
 
 
145 aa  179  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0513961  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3484  MarR family transcriptional regulator  64 
 
 
150 aa  177  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.643399  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4489  MarR family transcriptional regulator  65.22 
 
 
146 aa  174  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2731  MarR family transcriptional regulator  59.72 
 
 
148 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2885  MarR family transcriptional regulator  66.2 
 
 
156 aa  164  4e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311419  normal  0.195919 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3683  transcriptional regulator, MarR family  66.43 
 
 
153 aa  163  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3666  MarR family transcriptional regulator  63.38 
 
 
156 aa  159  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2486  MarR family transcriptional regulator  60.14 
 
 
148 aa  156  9e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0993114  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  56.03 
 
 
154 aa  149  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  56.03 
 
 
154 aa  149  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4517  MarR family transcriptional regulator  64.34 
 
 
172 aa  144  6e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.045561  normal  0.882671 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1112  putative transcription regulator protein  64.18 
 
 
139 aa  142  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0169999  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  54.86 
 
 
145 aa  135  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3628  hypothetical protein  53.15 
 
 
149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0952966  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  45.27 
 
 
149 aa  124  7e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  45.27 
 
 
149 aa  121  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  40.44 
 
 
149 aa  107  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  38.93 
 
 
144 aa  105  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3519  MarR family transcriptional regulator  44.27 
 
 
163 aa  101  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5489  MarR family transcriptional regulator  39.16 
 
 
154 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0914  transcriptional regulator, MarR family  44.14 
 
 
156 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3635  MarR family transcriptional regulator  38.97 
 
 
142 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4414  transcriptional regulator, MarR family  39.06 
 
 
140 aa  94.4  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.552703 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0734  MarR family transcriptional regulator  38.28 
 
 
140 aa  93.2  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2341  MarR family transcriptional regulator  41.27 
 
 
154 aa  92.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4605  MarR family transcriptional regulator  38.06 
 
 
142 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3758  MarR family transcriptional regulator  38.06 
 
 
142 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715353  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  38.06 
 
 
142 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1142  MarR family transcriptional regulator  40.6 
 
 
153 aa  91.3  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4036  MarR family transcriptional regulator  38.58 
 
 
134 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1281  MarR family transcriptional regulator  37.01 
 
 
134 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.841925 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4415  transcriptional regulator, MarR family  40.32 
 
 
140 aa  87.8  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.75195  normal  0.537773 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  36.88 
 
 
153 aa  87.8  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1683  MarR family transcriptional regulator  37.01 
 
 
134 aa  87  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.857494 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0078  MarR family transcriptional regulator  38.52 
 
 
138 aa  87  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2812  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
137 aa  85.9  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0746607  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2789  transcriptional regulator, MarR family  35.11 
 
 
156 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.591127 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4492  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
141 aa  86.3  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257685  normal  0.150503 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0735  MarR family transcriptional regulator  39.52 
 
 
138 aa  85.1  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0804  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
140 aa  83.6  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2003  MarR family transcriptional regulator  41.82 
 
 
144 aa  84  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4972  MarR family transcriptional regulator  37.69 
 
 
142 aa  84  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229805  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1241  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
134 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0049  MarR family transcriptional regulator  37.9 
 
 
171 aa  80.5  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68738  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11067  transcriptional repressor  35.92 
 
 
148 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.314337 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4493  MarR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.118843  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_004310  BR1572  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
136 aa  75.5  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3155  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 
132 aa  75.5  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4105  putative transcriptional regulator  38.32 
 
 
137 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727609  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1519  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.713594  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1595  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
133 aa  72.8  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.714194  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47580  MarR family transcriptional regulator  38.32 
 
 
149 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2350  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
212 aa  71.2  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.196227  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5550  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 
175 aa  70.5  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3544  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
165 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212056  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0886  transcriptional regulator, MarR family  33.88 
 
 
179 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0211  MarR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.739168  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1346  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1651  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467491 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  40.59 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1760  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0162725  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  37.23 
 
 
162 aa  63.5  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  37.76 
 
 
151 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1297  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
132 aa  63.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  36.61 
 
 
165 aa  62.4  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  39.6 
 
 
164 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
315 aa  62.8  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
165 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4071  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
157 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137556  normal  0.92805 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16300  transcriptional regulator, MarR family  38.95 
 
 
120 aa  60.8  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6446  transcriptional regulator, MarR family  31.75 
 
 
170 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
172 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
172 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3996  transcriptional regulator protein  34.58 
 
 
159 aa  60.5  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
172 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3831  transcriptional regulator, MarR family  33.85 
 
 
172 aa  60.1  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
172 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
172 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
219 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 
148 aa  59.7  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
200 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
172 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
172 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0969  transcriptional regulator, MarR family  34.02 
 
 
171 aa  59.3  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000635233  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4585  regulatory protein MarR  35.19 
 
 
159 aa  59.7  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4974  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.554489  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
165 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
165 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.469767 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>