More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2486 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2486  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 148 aa  292  9e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0993114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4489  MarR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 146 aa  191  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0815  transcriptional regulator, MarR family  62.16 
 
 		 171 aa  186  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134488  normal  0.259947 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0928  transcriptional regulator, MarR family  61.49 
 
 		 148 aa  179  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155001  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2731  MarR family transcriptional regulator  61.9 
 
 		 148 aa  176  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  59.46 
 
 		 155 aa  174  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0480  MarR family transcriptional regulator  60.14 
 
 		 149 aa  173  9e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600273  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0418  MarR family regulatory protein  60.14 
 
 		 149 aa  173  9e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  59.46 
 
 		 155 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  60.14 
 
 		 155 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1623  MarR family transcriptional regulator  59.86 
 
 		 145 aa  171  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0513961  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  60.14 
 
 		 155 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  59.03 
 
 		 155 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  61.27 
 
 		 158 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  64.39 
 
 		 154 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  64.39 
 
 		 154 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3484  MarR family transcriptional regulator  60.81 
 
 		 150 aa  159  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.643399  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3666  MarR family transcriptional regulator  64.29 
 
 		 156 aa  150  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2885  MarR family transcriptional regulator  63.57 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311419  normal  0.195919 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3683  transcriptional regulator, MarR family  67.94 
 
 		 153 aa  147  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  61.43 
 
 		 145 aa  147  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4517  MarR family transcriptional regulator  65.28 
 
 		 172 aa  140  8e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.045561  normal  0.882671 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3628  hypothetical protein  56.74 
 
 		 149 aa  134  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0952966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  45.95 
 
 		 149 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  47.76 
 
 		 149 aa  125  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  47.01 
 
 		 149 aa  124  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1112  putative transcription regulator protein  58.68 
 
 		 139 aa  120  9e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0169999  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4036  MarR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 134 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1281  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 134 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.841925 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1241  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 134 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 144 aa  87  9e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0914  transcriptional regulator, MarR family  39.66 
 
 		 156 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1683  MarR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.857494 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1142  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 153 aa  85.1  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2789  transcriptional regulator, MarR family  37.07 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.591127 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4105  putative transcriptional regulator  42.06 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727609  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0078  MarR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2003  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3544  MarR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47580  MarR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3519  MarR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 163 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1760  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0162725  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2812  MarR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0746607  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1651  MarR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467491 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0804  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 140 aa  73.6  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3996  transcriptional regulator protein  37.38 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11067  transcriptional repressor  34.96 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.314337 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0049  MarR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68738  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5489  MarR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1519  MarR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 136 aa  67  0.00000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.713594  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1572  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4605  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3155  transcriptional regulator, MarR family  31.75 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3758  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715353  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3635  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4972  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2341  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1595  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.714194  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5550  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4492  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257685  normal  0.150503 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4414  transcriptional regulator, MarR family  28.79 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.552703 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0734  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0735  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2350  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.196227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1346  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0331  hypothetical protein  29.25 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4115  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 146 aa  57  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 197 aa  57  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4415  transcriptional regulator, MarR family  29.92 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.75195  normal  0.537773 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5178  MarR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.638261 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0211  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.739168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2214  MarR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.693341 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16300  transcriptional regulator, MarR family  35.79 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 171 aa  54.3  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 178 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6446  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 		 170 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5260  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229053 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3161  regulatory protein, MarR  30.13 
 
 		 158 aa  53.5  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0336123  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  28.24 
 
 		 166 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  42.11 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3633  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 315 aa  53.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5487  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.84256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>