211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4115 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_4115  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 146 aa  285  1e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2789  transcriptional regulator, MarR family  39.82 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.591127 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0078  MarR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2003  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11067  transcriptional repressor  38.52 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.314337 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2812  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0746607  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0211  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 145 aa  67  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.739168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  32.23 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  41.51 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1241  MarR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4489  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1623  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0513961  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3996  transcriptional regulator protein  33.33 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0815  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134488  normal  0.259947 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1142  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4493  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.118843  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1346  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1281  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.841925 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0480  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600273  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0049  MarR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68738  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0418  MarR family regulatory protein  31.86 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3155  transcriptional regulator, MarR family  32.28 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2486  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0993114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3666  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47580  MarR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0928  transcriptional regulator, MarR family  32.74 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155001  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3628  hypothetical protein  35.71 
 
 		 149 aa  57  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0952966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4105  putative transcriptional regulator  35.4 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727609  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4972  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4036  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1760  MarR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0162725  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1683  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.857494 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3683  transcriptional regulator, MarR family  33.67 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  34.26 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0804  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2885  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311419  normal  0.195919 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1651  MarR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467491 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 154 aa  52.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 154 aa  52.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2731  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 155 aa  51.6  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0734  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3484  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.643399  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2380  transcriptional regulator, TrmB  26.5 
 
 		 132 aa  51.2  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.110085  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0914  transcriptional regulator, MarR family  30.97 
 
 		 156 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3544  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 165 aa  50.8  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 155 aa  50.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1595  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.714194  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5487  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 143 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.84256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3633  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 143 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1572  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4492  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257685  normal  0.150503 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1519  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.713594  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 175 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4415  transcriptional regulator, MarR family  31.5 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.75195  normal  0.537773 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1241  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0735  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4010  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.898778  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4071  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137556  normal  0.92805 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4974  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.554489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  39.81 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1901  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.015299 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  27.62 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1859  MarR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 154 aa  48.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4605  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3758  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715353  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3003  transcriptional regulator, MarR family  37.78 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6446  transcriptional regulator, MarR family  32.28 
 
 		 170 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2343  hypothetical protein  27.73 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0886  transcriptional regulator, MarR family  32.54 
 
 		 179 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2978  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 170 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4414  transcriptional regulator, MarR family  27.97 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.552703 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 169 aa  47.8  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2919  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 162 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 162 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4517  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 172 aa  47  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.045561  normal  0.882671 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>