More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4395 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 139 aa  283  4e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1623  MarR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0513961  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0133  regulatory protein MarR  41.3 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  38.04 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2456  transcriptional regulator, MarR family  38.04 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2842  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 154 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  41.3 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  37.61 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  40.22 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  35.87 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 143 aa  70.1  0.000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  40.66 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8732  hypothetical protein  38.52 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2174  transcriptional regulator, MarR family  38.04 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.789823  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0815  transcriptional regulator, MarR family  33.91 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134488  normal  0.259947 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1979  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.293759  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  33.64 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  38.04 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  38.04 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  38.04 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  38.04 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  40.22 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0928  transcriptional regulator, MarR family  36.26 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155001  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2410  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 148 aa  67  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.83816  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 138 aa  67  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 156 aa  67  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2457  regulatory protein MarR  34.78 
 
 		 148 aa  67  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.368665  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  39.06 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0480  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600273  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4489  MarR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  36.96 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0418  MarR family regulatory protein  34.69 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1597  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2280  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.421231  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0803  transcriptional regulator, MarR family protein  29.75 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  32.73 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2731  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4493  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.118843  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0865  transcriptional regulator, MarR family  38.26 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  36.96 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0796  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.517671  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2658  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563591  normal  0.690586 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4585  regulatory protein MarR  34.78 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  35.87 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  35.87 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  35.87 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  34.41 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0840  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.779945  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27530  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 163 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.037283 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 160 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1910  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.852737  normal  0.275089 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 169 aa  63.5  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 159 aa  63.5  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  35.87 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  36.96 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0818  transcriptional regulator, MarR family  34.56 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  35.87 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  35.87 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2330  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  38.04 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.440211 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>