More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0865 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0865  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
153 aa  306  6.999999999999999e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  43.92 
 
 
150 aa  136  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  44.06 
 
 
150 aa  134  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  44.37 
 
 
150 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  43.66 
 
 
150 aa  133  9e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  43.66 
 
 
150 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  43.66 
 
 
150 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  43.66 
 
 
150 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  43.66 
 
 
150 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  43.66 
 
 
150 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  43.66 
 
 
150 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  48.34 
 
 
178 aa  130  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  47.48 
 
 
151 aa  125  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  47.83 
 
 
146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  50.38 
 
 
149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  46.76 
 
 
155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  46.04 
 
 
158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  47.18 
 
 
154 aa  124  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  47.18 
 
 
154 aa  124  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  45.14 
 
 
147 aa  124  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  45.14 
 
 
147 aa  124  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  46.58 
 
 
162 aa  123  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  44.52 
 
 
164 aa  122  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  46.76 
 
 
154 aa  122  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  48.85 
 
 
166 aa  121  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  46.38 
 
 
156 aa  121  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0969  transcriptional regulator, MarR family  43.84 
 
 
171 aa  121  3e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000635233  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  52.25 
 
 
152 aa  120  7e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  42.55 
 
 
153 aa  120  9e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  48.76 
 
 
149 aa  119  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  47.32 
 
 
151 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20780  transcriptional regulator, MarR family  44.76 
 
 
152 aa  119  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  46.56 
 
 
166 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  52.29 
 
 
149 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  48.67 
 
 
151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  46.1 
 
 
153 aa  118  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  44.9 
 
 
143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  44.6 
 
 
158 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  46.48 
 
 
149 aa  118  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  44.6 
 
 
159 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  45.65 
 
 
145 aa  118  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  42.55 
 
 
146 aa  118  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  50.83 
 
 
195 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  50.83 
 
 
161 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  43.8 
 
 
185 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  46.97 
 
 
151 aa  117  4.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  51.38 
 
 
149 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  41.13 
 
 
156 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  48.89 
 
 
161 aa  117  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  44.37 
 
 
147 aa  116  9e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  45.93 
 
 
157 aa  116  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  46.88 
 
 
170 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2330  MarR family transcriptional regulator  47.59 
 
 
163 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  43.24 
 
 
147 aa  116  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  50.45 
 
 
156 aa  116  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  44.53 
 
 
154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  46.77 
 
 
151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  43.97 
 
 
152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  47.14 
 
 
146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  47.75 
 
 
150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  44.68 
 
 
153 aa  115  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2738  transcriptional regulator, MarR family  41.26 
 
 
156 aa  114  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.708856 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  49.54 
 
 
162 aa  115  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  48.21 
 
 
155 aa  115  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  41.55 
 
 
165 aa  115  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27530  MarR family transcriptional regulator  46.9 
 
 
163 aa  115  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.037283 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  46.97 
 
 
151 aa  114  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  49.54 
 
 
157 aa  114  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  47.14 
 
 
146 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  47.14 
 
 
146 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3980  MarR family transcriptional regulator  50.89 
 
 
153 aa  114  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436486  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  50.93 
 
 
148 aa  114  6e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  45.67 
 
 
158 aa  113  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2661  MarR family transcriptional regulator  43.97 
 
 
145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00131118  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 
145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  46.32 
 
 
153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  43.48 
 
 
146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5382  transcriptional regulator, MarR family  47.52 
 
 
157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  40.14 
 
 
165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  38.85 
 
 
161 aa  111  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  38.57 
 
 
157 aa  111  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4585  regulatory protein MarR  48.7 
 
 
159 aa  111  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  42.55 
 
 
171 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3139  transcriptional regulator, MarR family  42.65 
 
 
183 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  46.09 
 
 
159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3161  regulatory protein, MarR  45.69 
 
 
158 aa  110  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0336123  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5817  MarR family transcriptional regulator  44.12 
 
 
146 aa  110  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.127726 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  46.15 
 
 
167 aa  110  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  43.15 
 
 
149 aa  110  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  47.83 
 
 
159 aa  110  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  42.45 
 
 
153 aa  110  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  48.15 
 
 
153 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  45.16 
 
 
152 aa  110  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0818  transcriptional regulator, MarR family  44.26 
 
 
147 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  39.57 
 
 
151 aa  110  9e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00814  putative transcription regulator protein  46.85 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335151  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1910  MarR family transcriptional regulator  46.72 
 
 
152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0578168  normal  0.331204 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  46.79 
 
 
162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  40.14 
 
 
165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  50.42 
 
 
169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>