More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8732 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8732  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  272  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0346  MarR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 171 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.668512  normal  0.0212996 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2545  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 163 aa  100  9e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00936337  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2282  transcriptional regulator, MarR family  42.75 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000450533 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2106  transcriptional regulator, MarR family  41.59 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0650489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15420  transcriptional regulator  39.86 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  41.74 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0053  transcriptional regulator, MarR family  40.16 
 
 		 198 aa  63.9  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2456  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3177  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000202979  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1979  MarR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.293759  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2174  transcriptional regulator, MarR family  37.18 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.789823  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 153 aa  57  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  38.96 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  33.79 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  31.31 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  36.76 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  41.57 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0707  regulatory protein MarR  35.16 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2457  regulatory protein MarR  23.23 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.368665  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  35.11 
 
 		 162 aa  52.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2410  MarR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.83816  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  39.08 
 
 		 170 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0705  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 156 aa  52.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 145 aa  52.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  39.58 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  39.08 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 		 153 aa  51.6  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0686  transcriptional regulator, MarR family  34.11 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3139  transcriptional regulator, MarR family  38.82 
 
 		 183 aa  51.6  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2768  MarR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 143 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0549  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 167 aa  51.2  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 		 156 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3189  regulatory protein, MarR  37.36 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  33.6 
 
 		 175 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 153 aa  50.4  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  33.72 
 
 		 156 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  32.28 
 
 		 143 aa  50.4  0.000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 161 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  38.75 
 
 		 169 aa  50.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  32.32 
 
 		 147 aa  50.1  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 156 aa  50.4  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  32.32 
 
 		 147 aa  50.1  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0818  transcriptional regulator, MarR family  38.82 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0777  transcriptional regulator, MarR family  27.59 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.105797  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  32.94 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2738  transcriptional regulator, MarR family  33.72 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.708856 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20780  transcriptional regulator, MarR family  27.66 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  32.18 
 
 		 195 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0342  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0710  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  36.61 
 
 		 169 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2280  MarR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 170 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.421231  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 147 aa  48.1  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  40.51 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0726  regulatory protein MarR  33.71 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>