More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3838 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 154 aa  297  3e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 154 aa  297  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2731  MarR family transcriptional regulator  63.16 
 
 		 148 aa  171  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0928  transcriptional regulator, MarR family  58.14 
 
 		 148 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155001  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0418  MarR family regulatory protein  57.36 
 
 		 149 aa  150  8.999999999999999e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0480  MarR family transcriptional regulator  57.36 
 
 		 149 aa  150  8.999999999999999e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600273  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1623  MarR family transcriptional regulator  59.84 
 
 		 145 aa  150  8.999999999999999e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0513961  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  56.03 
 
 		 155 aa  149  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  59.38 
 
 		 158 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4489  MarR family transcriptional regulator  59.09 
 
 		 146 aa  148  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  57.69 
 
 		 155 aa  148  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0815  transcriptional regulator, MarR family  56.82 
 
 		 171 aa  148  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134488  normal  0.259947 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  57.69 
 
 		 155 aa  148  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  56.92 
 
 		 155 aa  147  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2486  MarR family transcriptional regulator  64.39 
 
 		 148 aa  145  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0993114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  56.15 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  58.7 
 
 		 145 aa  134  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3484  MarR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 150 aa  133  7.000000000000001e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.643399  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2885  MarR family transcriptional regulator  53.9 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311419  normal  0.195919 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3666  MarR family transcriptional regulator  51.68 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3683  transcriptional regulator, MarR family  55.78 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  45.52 
 
 		 149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  44.03 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4517  MarR family transcriptional regulator  58.7 
 
 		 172 aa  121  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.045561  normal  0.882671 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 149 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3628  hypothetical protein  61.74 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0952966  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1112  putative transcription regulator protein  64.58 
 
 		 139 aa  110  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0169999  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0914  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 156 aa  91.3  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1281  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 134 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.841925 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2812  MarR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 137 aa  89.7  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0746607  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2003  MarR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 144 aa  89.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0078  MarR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 138 aa  89  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0804  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 140 aa  88.6  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1142  MarR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 153 aa  87.4  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11067  transcriptional repressor  38.03 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.314337 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4036  MarR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4105  putative transcriptional regulator  40.48 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727609  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3996  transcriptional regulator protein  35.66 
 
 		 159 aa  84.3  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47580  MarR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 149 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1683  MarR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.857494 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1241  MarR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2789  transcriptional regulator, MarR family  36.13 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.591127 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0049  MarR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68738  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5489  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0211  MarR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.739168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1651  MarR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467491 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3519  MarR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3635  MarR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4605  MarR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3758  MarR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715353  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2341  MarR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 154 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4492  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257685  normal  0.150503 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_004310  BR1572  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1519  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.713594  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3544  MarR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 165 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0734  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 140 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3155  transcriptional regulator, MarR family  36.52 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6446  transcriptional regulator, MarR family  41.12 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2350  MarR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.196227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1760  MarR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0162725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4414  transcriptional regulator, MarR family  29.51 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.552703 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1346  MarR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4972  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 142 aa  67  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1595  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 133 aa  67  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.714194  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5550  transcriptional regulator, MarR family  34.26 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0735  MarR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4493  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.118843  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0886  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4415  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.75195  normal  0.537773 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5260  MarR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 164 aa  62  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229053 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2670  regulatory protein MarR  35.11 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  38.3 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3314  transcriptional regulator, MarR family  27.56 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3099  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.634884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3085  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.729277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2996  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000177119  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4585  regulatory protein MarR  32.12 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3344  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3304  transcriptional regulator, MarR family  27.56 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3321  transcriptional regulator, MarR family  27.56 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5359  transcriptional regulator, MarR family  33.9 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.157923  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3308  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1928  transcriptional regulator, MarR family  27.56 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.428879 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16300  transcriptional regulator, MarR family  37.86 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0586  MarR family regulatory protein  34.03 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.7562  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  39.08 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3012  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135712  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1241  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 170 aa  57.4  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 141 aa  57  0.00000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>