99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2350 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2350  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 212 aa  423  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.196227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5550  transcriptional regulator, MarR family  76.14 
 
 		 175 aa  253  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6446  transcriptional regulator, MarR family  56.55 
 
 		 170 aa  154  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0886  transcriptional regulator, MarR family  57.93 
 
 		 179 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0049  MarR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68738  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2731  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0418  MarR family regulatory protein  34.93 
 
 		 149 aa  73.9  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0480  MarR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 149 aa  73.9  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600273  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 155 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 155 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 144 aa  70.5  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2341  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0928  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155001  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4492  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257685  normal  0.150503 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3635  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5489  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3758  MarR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715353  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4605  MarR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4414  transcriptional regulator, MarR family  31.94 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.552703 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0815  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134488  normal  0.259947 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 155 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4493  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 147 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.118843  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1623  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0513961  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  33.59 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0734  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 		 149 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  36.04 
 
 		 149 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2343  hypothetical protein  34.15 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5359  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.157923  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4489  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 146 aa  62  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4974  MarR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 143 aa  62  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.554489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3633  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5487  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.84256  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0804  MarR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 140 aa  60.8  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3484  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 150 aa  61.2  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.643399  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11067  transcriptional repressor  35 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.314337 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2789  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.591127 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1346  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4105  putative transcriptional regulator  33.08 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727609  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3767  regulatory protein MarR  33.33 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.178096 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3696  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2812  MarR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 137 aa  57.8  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0746607  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3519  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 163 aa  57.8  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1142  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 153 aa  57.8  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47580  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 149 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2885  MarR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311419  normal  0.195919 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4415  transcriptional regulator, MarR family  31.34 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.75195  normal  0.537773 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2670  regulatory protein MarR  32.33 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0735  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4607  regulatory protein, MarR  31.71 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3756  regulatory protein, MarR  31.71 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.203482  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0078  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1112  putative transcription regulator protein  33.33 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0169999  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2486  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 148 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0993114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3155  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 132 aa  54.3  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1519  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 136 aa  54.3  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.713594  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2003  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 144 aa  54.3  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1572  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 136 aa  53.9  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3545  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 161 aa  53.9  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359326  normal  0.253547 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4036  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 134 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2978  MarR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 170 aa  53.1  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3666  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 156 aa  52.8  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1683  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 134 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.857494 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 145 aa  52.4  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3628  hypothetical protein  29.46 
 
 		 149 aa  52.4  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0952966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1697  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 160 aa  52.4  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267182  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1281  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 134 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.841925 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06310  transcriptional regulator  35.96 
 
 		 169 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1901  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 168 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.015299 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2923  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 158 aa  50.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4071  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 157 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137556  normal  0.92805 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1241  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 134 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0211  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 145 aa  49.3  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.739168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1595  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 133 aa  48.9  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.714194  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3683  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 153 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0914  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 156 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4972  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 142 aa  47.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1241  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 151 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4517  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 172 aa  47.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.045561  normal  0.882671 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3996  transcriptional regulator protein  28.7 
 
 		 159 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1651  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 134 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467491 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1760  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 134 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0162725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 139 aa  46.2  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  27.94 
 
 		 152 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3003  transcriptional regulator, MarR family  38.21 
 
 		 142 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3544  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 165 aa  45.1  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212056  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 153 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3110  transcriptional regulator, MarR family  36.29 
 
 		 142 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 296 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2919  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 142 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3512  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 156 aa  41.6  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 152 aa  42  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>