More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5489 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5489  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 154 aa  315  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2341  MarR family transcriptional regulator  90.91 
 
 		 154 aa  288  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3635  MarR family transcriptional regulator  98.59 
 
 		 142 aa  286  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4605  MarR family transcriptional regulator  89.44 
 
 		 142 aa  263  7e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3758  MarR family transcriptional regulator  89.44 
 
 		 142 aa  263  7e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715353  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  89.44 
 
 		 142 aa  263  8e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4972  MarR family transcriptional regulator  71.83 
 
 		 142 aa  208  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4492  MarR family transcriptional regulator  65.65 
 
 		 141 aa  189  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257685  normal  0.150503 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4414  transcriptional regulator, MarR family  65.65 
 
 		 140 aa  179  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.552703 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0734  MarR family transcriptional regulator  63.36 
 
 		 140 aa  175  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4493  MarR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 147 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.118843  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4415  transcriptional regulator, MarR family  48.84 
 
 		 140 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.75195  normal  0.537773 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0735  MarR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 138 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4974  MarR family transcriptional regulator  50.78 
 
 		 143 aa  121  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.554489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4607  regulatory protein, MarR  49.61 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3756  regulatory protein, MarR  49.61 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.203482  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3767  regulatory protein MarR  49.61 
 
 		 143 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.178096 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5487  MarR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 143 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.84256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3633  MarR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 143 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2343  hypothetical protein  49.61 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 144 aa  103  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 155 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0804  MarR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 140 aa  99.4  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 155 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 155 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0928  transcriptional regulator, MarR family  35.86 
 
 		 148 aa  90.5  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155001  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0480  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 149 aa  90.5  8e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600273  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0418  MarR family regulatory protein  35.42 
 
 		 149 aa  90.5  8e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 155 aa  90.5  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2731  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 148 aa  90.1  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 158 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0424  MarR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 155 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.476244  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0586  MarR family regulatory protein  38.73 
 
 		 164 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.7562  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 155 aa  88.6  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1519  MarR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 136 aa  87.4  6e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.713594  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0815  transcriptional regulator, MarR family  34.75 
 
 		 171 aa  86.7  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134488  normal  0.259947 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1142  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 153 aa  86.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 153 aa  86.7  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3093  MarR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1572  MarR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 136 aa  85.9  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0089  MarR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2003  MarR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2285  MarR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.864353  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0404  MarR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 138 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0144354  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1595  MarR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 133 aa  84  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.714194  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0350  MarR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 138 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3484  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.643399  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0049  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 171 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68738  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3519  MarR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2812  MarR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0746607  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4105  putative transcriptional regulator  37.7 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727609  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2789  transcriptional regulator, MarR family  30.37 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.591127 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1623  MarR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0513961  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4489  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4036  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2003  MarR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47580  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0078  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3155  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1901  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 168 aa  73.9  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.015299 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1683  MarR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.857494 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0914  transcriptional regulator, MarR family  33.86 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11067  transcriptional repressor  38.76 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.314337 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1112  putative transcription regulator protein  38.21 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0169999  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 145 aa  72  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1297  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  31.85 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2923  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1241  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  36.04 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 		 149 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3545  MarR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359326  normal  0.253547 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5550  transcriptional regulator, MarR family  33.1 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2350  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.196227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1281  MarR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.841925 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3666  MarR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2885  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311419  normal  0.195919 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0211  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.739168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1241  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 134 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1346  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1697  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267182  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1651  MarR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467491 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3696  transcriptional regulator, MarR family  32.31 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0886  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 		 179 aa  63.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3683  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1760  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0162725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2486  MarR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0993114  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6446  transcriptional regulator, MarR family  32.54 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  35.8 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2978  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  34.57 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  34.57 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1722  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>