More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3199 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 149 aa  295  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  52.82 
 
 		 149 aa  155  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  52.11 
 
 		 149 aa  153  6e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0480  MarR family transcriptional regulator  51.28 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600273  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0418  MarR family regulatory protein  51.28 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2731  MarR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0928  transcriptional regulator, MarR family  42.57 
 
 		 148 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155001  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4489  MarR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 146 aa  114  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0815  transcriptional regulator, MarR family  41.61 
 
 		 171 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134488  normal  0.259947 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2486  MarR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0993114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1623  MarR family transcriptional regulator  45.53 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0513961  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0914  transcriptional regulator, MarR family  43.61 
 
 		 156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 155 aa  107  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  44.92 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 155 aa  105  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  44.92 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2812  MarR family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 137 aa  101  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0746607  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3484  MarR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 150 aa  98.2  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.643399  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4036  MarR family transcriptional regulator  46.96 
 
 		 134 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2885  MarR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 156 aa  94.7  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311419  normal  0.195919 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1683  MarR family transcriptional regulator  46.96 
 
 		 134 aa  94  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.857494 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1281  MarR family transcriptional regulator  45.69 
 
 		 134 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.841925 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1241  MarR family transcriptional regulator  45.69 
 
 		 134 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3666  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 156 aa  90.9  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1142  MarR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 153 aa  90.9  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4105  putative transcriptional regulator  43.41 
 
 		 137 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727609  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3628  hypothetical protein  44.36 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0952966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  45.3 
 
 		 145 aa  89.4  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3683  transcriptional regulator, MarR family  47.32 
 
 		 153 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0049  MarR family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 171 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68738  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2789  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 		 156 aa  87  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.591127 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1112  putative transcription regulator protein  52.08 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0169999  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0078  MarR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47580  MarR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 149 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2003  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3996  transcriptional regulator protein  39.25 
 
 		 159 aa  80.5  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1651  MarR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467491 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3519  MarR family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3155  transcriptional regulator, MarR family  37.39 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4517  MarR family transcriptional regulator  47.93 
 
 		 172 aa  78.6  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.045561  normal  0.882671 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16300  transcriptional regulator, MarR family  45.19 
 
 		 120 aa  74.7  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11067  transcriptional repressor  39.47 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.314337 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1519  MarR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.713594  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6446  transcriptional regulator, MarR family  40.54 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1572  MarR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 136 aa  73.9  0.0000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5550  transcriptional regulator, MarR family  38.26 
 
 		 175 aa  73.9  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1346  MarR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2341  MarR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 154 aa  72  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2670  regulatory protein MarR  39.42 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1595  MarR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.714194  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0886  transcriptional regulator, MarR family  38.05 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4605  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3758  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715353  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0211  MarR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.739168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1760  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0162725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5489  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3635  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3110  transcriptional regulator, MarR family  43.86 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2923  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3003  transcriptional regulator, MarR family  43.48 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  29.23 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0735  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2350  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 212 aa  64.3  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.196227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  38.06 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0804  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4071  MarR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137556  normal  0.92805 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4415  transcriptional regulator, MarR family  31.97 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.75195  normal  0.537773 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4115  MarR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2919  MarR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5260  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 164 aa  62  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229053 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4414  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.552703 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1901  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.015299 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0734  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  35.65 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4493  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.118843  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1697  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.267182  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4492  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257685  normal  0.150503 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0718  regulatory protein, MarR  37.74 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000013596  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4585  regulatory protein MarR  38.24 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  37.11 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>