More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3956 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 158 aa  316  7.999999999999999e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  96.84 
 
 		 155 aa  303  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  92.99 
 
 		 155 aa  290  4e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  88.54 
 
 		 155 aa  273  5e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  85.99 
 
 		 155 aa  266  8e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  84.18 
 
 		 155 aa  264  4e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0480  MarR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 149 aa  187  5e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600273  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0418  MarR family regulatory protein  66.67 
 
 		 149 aa  187  5e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1623  MarR family transcriptional regulator  65.03 
 
 		 145 aa  183  7e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0513961  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0815  transcriptional regulator, MarR family  62.68 
 
 		 171 aa  183  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134488  normal  0.259947 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0928  transcriptional regulator, MarR family  62.68 
 
 		 148 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155001  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4489  MarR family transcriptional regulator  65.25 
 
 		 146 aa  177  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3484  MarR family transcriptional regulator  66.2 
 
 		 150 aa  175  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.643399  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2731  MarR family transcriptional regulator  60 
 
 		 148 aa  173  9e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3683  transcriptional regulator, MarR family  66.43 
 
 		 153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2885  MarR family transcriptional regulator  65.71 
 
 		 156 aa  160  6e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311419  normal  0.195919 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3666  MarR family transcriptional regulator  62.14 
 
 		 156 aa  155  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2486  MarR family transcriptional regulator  61.27 
 
 		 148 aa  153  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0993114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  59.38 
 
 		 154 aa  149  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  59.38 
 
 		 154 aa  149  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4517  MarR family transcriptional regulator  63.76 
 
 		 172 aa  143  8.000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.045561  normal  0.882671 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1112  putative transcription regulator protein  67.2 
 
 		 139 aa  143  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0169999  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  62.3 
 
 		 145 aa  138  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3628  hypothetical protein  52.82 
 
 		 149 aa  125  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0952966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  48.8 
 
 		 149 aa  117  6e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  46.67 
 
 		 149 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  44.92 
 
 		 149 aa  106  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3519  MarR family transcriptional regulator  43.85 
 
 		 163 aa  98.2  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 144 aa  97.1  8e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0914  transcriptional regulator, MarR family  43.24 
 
 		 156 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1281  MarR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.841925 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5489  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 154 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4036  MarR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1142  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 153 aa  89  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 153 aa  89.4  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4605  MarR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 142 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3758  MarR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 142 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715353  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1683  MarR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 134 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.857494 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 142 aa  87.8  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0804  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3635  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0078  MarR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 138 aa  85.1  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2341  MarR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 154 aa  84.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1241  MarR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 134 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0734  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 140 aa  83.6  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4414  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.552703 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2812  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0746607  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2789  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.591127 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1595  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 133 aa  82  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.714194  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0049  MarR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 171 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.68738  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4415  transcriptional regulator, MarR family  38.71 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.75195  normal  0.537773 
 
 
-
 
NC_004310  BR1572  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2003  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4105  putative transcriptional regulator  39.25 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727609  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1519  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 136 aa  80.1  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.713594  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11067  transcriptional repressor  39.32 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.314337 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0735  MarR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4492  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257685  normal  0.150503 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4972  MarR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47580  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4493  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.118843  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3155  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 132 aa  73.6  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  40.82 
 
 		 162 aa  72  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5550  transcriptional regulator, MarR family  32.31 
 
 		 175 aa  70.9  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2350  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.196227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3544  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 165 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1297  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 132 aa  67  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 161 aa  67  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1760  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0162725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1651  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467491 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  33.93 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1346  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0211  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.739168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  36.04 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0797  MarR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 161 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0886  transcriptional regulator, MarR family  32.23 
 
 		 179 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2923  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 158 aa  62  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  37.62 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3996  transcriptional regulator protein  33.65 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4585  regulatory protein MarR  35.19 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  32.52 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  35.24 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  36.73 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  33.66 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  36.73 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>