More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3143 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
161 aa  322  1e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  49.34 
 
 
178 aa  137  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  48.89 
 
 
153 aa  133  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  50.35 
 
 
190 aa  132  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  45.26 
 
 
151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  44.53 
 
 
150 aa  125  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  49.64 
 
 
177 aa  123  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5695  transcriptional regulator, MarR family  46.53 
 
 
155 aa  121  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  41.06 
 
 
169 aa  121  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
148 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  41.04 
 
 
159 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5689  MarR family transcriptional regulator  41.84 
 
 
150 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868849  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0279  MarR family transcriptional regulator  42.75 
 
 
158 aa  105  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.468058  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
157 aa  103  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  42.76 
 
 
161 aa  103  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  38.35 
 
 
172 aa  100  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  40.29 
 
 
175 aa  99  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  39.01 
 
 
172 aa  99  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  38.85 
 
 
176 aa  98.2  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  38.57 
 
 
174 aa  98.2  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4590  MarR family transcriptional regulator  45.65 
 
 
185 aa  97.8  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777081  normal  0.899831 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  40.6 
 
 
188 aa  97.4  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5123  MarR family transcriptional regulator  45.65 
 
 
179 aa  97.4  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126201  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3125  MarR family transcriptional regulator  45.65 
 
 
162 aa  97.1  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0374972  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5242  MarR family transcriptional regulator  45.65 
 
 
162 aa  97.1  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0421  MarR family transcriptional regulator  44.93 
 
 
162 aa  95.5  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.799944  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
189 aa  94.4  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5030  MarR family transcriptional regulator  44.93 
 
 
162 aa  93.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.942025 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
184 aa  91.7  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  35.77 
 
 
176 aa  91.3  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
151 aa  89  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
315 aa  86.7  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
158 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 
143 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  37.06 
 
 
172 aa  82  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2313  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
157 aa  80.9  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  40.35 
 
 
151 aa  80.9  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  35.43 
 
 
170 aa  80.9  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0934  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
303 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213342  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  33.86 
 
 
160 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  34.56 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
172 aa  78.2  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
158 aa  77.4  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
158 aa  77.4  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
195 aa  76.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
158 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
154 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
137 aa  72  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 
158 aa  71.2  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  36.59 
 
 
169 aa  71.2  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  30.15 
 
 
142 aa  70.5  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
158 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  30.15 
 
 
142 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
174 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  33.59 
 
 
134 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  33.59 
 
 
134 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  38.95 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  33.59 
 
 
134 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  33.59 
 
 
134 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  29.86 
 
 
201 aa  68.9  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  33.59 
 
 
134 aa  68.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3041  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
135 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  38.95 
 
 
155 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
205 aa  67  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2865  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
135 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2016  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
167 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  35.85 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 
143 aa  67  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
158 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 
143 aa  67  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0283  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.34751  hitchhiker  0.000254243 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  43.3 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  32.28 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  30.82 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  33.62 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  42.27 
 
 
157 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3991  transcriptional regulator, MarR family  32.71 
 
 
135 aa  64.7  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  27.2 
 
 
148 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  26.4 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  26.4 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 
148 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1859  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 
154 aa  63.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  27.01 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
159 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 
148 aa  63.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 
148 aa  63.2  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 
148 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 
148 aa  63.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  26.4 
 
 
148 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  25.6 
 
 
148 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1762  transcriptional regulator, MarR family  38.17 
 
 
196 aa  62.4  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  37.36 
 
 
155 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 
167 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
153 aa  62  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  34.15 
 
 
156 aa  61.2  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>