265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1762 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1762  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
196 aa  394  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3267  transcriptional regulator, MarR family  38.95 
 
 
207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4421  transcriptional regulator, MarR family  37.37 
 
 
197 aa  104  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.636596  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  32.09 
 
 
208 aa  102  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1206  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
206 aa  100  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2109  MarR family transcriptional regulator  41.96 
 
 
145 aa  95.1  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0003  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0838682  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3929  transcriptional regulator, MarR family  29.67 
 
 
212 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000837661  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3063  MarR family transcriptional regulator  29.19 
 
 
214 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565179  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0565  MarR family transcriptional regulator  31.61 
 
 
189 aa  74.7  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0658  MarR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
191 aa  73.6  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4139  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
201 aa  72.4  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0088  MarR family transcriptional regulator  27.47 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.519459 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2985  MarR family transcriptional regulator  27.47 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0529502  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0070  MarR family transcriptional regulator  27.47 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5106  transcriptional regulator, MarR family  23.46 
 
 
206 aa  68.2  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248862  normal  0.417373 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3251  MarR family transcriptional regulator  28.11 
 
 
212 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2918  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2977  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0213  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3344  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1624  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3392  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0069  MarR family transcriptional regulator  26.49 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.373152  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0061  MarR family transcriptional regulator  26.49 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4012  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
200 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.911422  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4084  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
200 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.574763  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0070  MarR family transcriptional regulator  27.57 
 
 
212 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0504  transcriptional regulator, TrmB  29.87 
 
 
176 aa  63.2  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.21026 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  38.17 
 
 
161 aa  62.4  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1088  MarR family transcriptional regulator  26.78 
 
 
199 aa  62  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1858  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 
196 aa  61.6  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.642234  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0210  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 
224 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.133838 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1921  MarR family transcriptional regulator  26.88 
 
 
190 aa  59.3  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2045  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 
190 aa  58.5  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2951  MarR family transcriptional regulator  44.3 
 
 
162 aa  58.5  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144629  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3156  MarR family transcriptional regulator  44.87 
 
 
141 aa  57.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.646258 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  36.21 
 
 
142 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1302  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 
142 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  37.41 
 
 
172 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 
142 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
153 aa  55.8  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 
142 aa  54.7  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 
142 aa  53.9  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 
160 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5835  transcriptional regulator, MarR family  35.4 
 
 
144 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0228  MarR family transcriptional regulator  26.37 
 
 
192 aa  52.4  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 
158 aa  52  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  35.97 
 
 
171 aa  52  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  29.77 
 
 
156 aa  51.6  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  36.07 
 
 
162 aa  51.6  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
157 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 
157 aa  51.2  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2084  MarR family transcriptional regulator  40.4 
 
 
155 aa  51.2  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 
168 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
157 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1927  transcriptional regulator, MarR family  25.67 
 
 
187 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
171 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  34.01 
 
 
190 aa  50.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3831  transcriptional regulator, MarR family  43.75 
 
 
172 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2274  MarR family transcriptional regulator  38.36 
 
 
167 aa  48.9  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  23.08 
 
 
146 aa  49.3  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 
157 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1251  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 
155 aa  49.3  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 
157 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  31.29 
 
 
164 aa  48.9  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  30.94 
 
 
154 aa  48.5  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 
146 aa  48.1  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1718  transcriptional regulator, MarR family  27.37 
 
 
159 aa  48.1  0.00008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
164 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 
188 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 
146 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0479  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 
155 aa  47.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 
146 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4485  MarR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
160 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.187713  normal  0.500577 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1402  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
137 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  38.75 
 
 
145 aa  47  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  38.75 
 
 
146 aa  47  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1487  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
151 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5413  transcriptional regulator, MarR family  37.97 
 
 
146 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.173086 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1198  hypothetical protein  38.64 
 
 
137 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240784  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 
167 aa  46.6  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1139  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
141 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0006  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
137 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862573  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1396  hypothetical protein  37.65 
 
 
160 aa  47  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  33.87 
 
 
157 aa  47.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 
146 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2911  transcriptional regulator, MarR family  23.64 
 
 
218 aa  47  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.233066  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 
146 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5455  hypothetical protein  33.59 
 
 
180 aa  47  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0160  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
141 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0438  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
141 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37846  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
147 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  35.11 
 
 
150 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
157 aa  45.8  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2101  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
163 aa  46.2  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0043362  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
163 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4542  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
158 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  0.070316 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 
340 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2690  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
188 aa  46.6  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>