More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3320 on replicon NC_014213
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  298  2e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  38.28 
 
 
137 aa  85.5  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  37.14 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  41.22 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
158 aa  80.5  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 
142 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  43.3 
 
 
160 aa  77.8  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  41.84 
 
 
157 aa  77.8  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
149 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  35.61 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  36.07 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  31.16 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2225  MarR family transcriptional regulator  36.03 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  34.81 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  45.05 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6003  MarR family transcriptional regulator  34.03 
 
 
244 aa  70.5  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  36.72 
 
 
174 aa  70.1  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
167 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  30.56 
 
 
172 aa  69.7  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2082  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 
158 aa  69.3  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  43.02 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  42.53 
 
 
194 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1214  transcriptional regulator, MarR family  35.66 
 
 
162 aa  68.2  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0962151 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  37.62 
 
 
177 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  36.46 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2538  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 
154 aa  65.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474386  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  32.99 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  35.45 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  42.17 
 
 
171 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  37.37 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
148 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
143 aa  63.5  0.0000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
143 aa  63.5  0.0000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  27.07 
 
 
172 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  34.4 
 
 
161 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06310  transcriptional regulator  33.1 
 
 
169 aa  62.8  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
171 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3834  transcriptional regulator, MarR family  34.59 
 
 
175 aa  62.4  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  40.26 
 
 
145 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3615  transcriptional regulator, MarR family  36.69 
 
 
158 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210335  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3114  transcriptional regulator, MarR family  42.31 
 
 
186 aa  62  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000547755 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 
140 aa  62  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  42.17 
 
 
171 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  30 
 
 
147 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1620  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 
140 aa  61.6  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664296  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  35.64 
 
 
176 aa  61.6  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
150 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
303 aa  61.6  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
170 aa  61.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  34.88 
 
 
153 aa  61.6  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  33.56 
 
 
172 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  34.31 
 
 
154 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 
193 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  33.64 
 
 
146 aa  60.8  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  38.96 
 
 
151 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3853  regulatory protein, MarR  37.04 
 
 
162 aa  60.8  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295322  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
174 aa  60.5  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 
169 aa  60.5  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0283  transcriptional regulator, MarR family  34.9 
 
 
157 aa  60.5  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.34751  hitchhiker  0.000254243 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  38.96 
 
 
150 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  33.88 
 
 
172 aa  60.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  33.09 
 
 
140 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 
147 aa  60.5  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  27.86 
 
 
153 aa  60.5  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1929  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 
149 aa  60.5  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  29.01 
 
 
147 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  30.47 
 
 
161 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 
164 aa  60.1  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  30.47 
 
 
149 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  32.84 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
172 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
160 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  33.33 
 
 
168 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  31.78 
 
 
156 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  25.56 
 
 
149 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
184 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
154 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  33 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6031  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 
159 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
172 aa  58.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  40.96 
 
 
178 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2593  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 
148 aa  57.8  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 
164 aa  57.4  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 
146 aa  57.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.683287 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>