More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5904 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 172 aa  350  8e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5755  transcriptional regulator, MarR family  41.98 
 
 		 142 aa  84.7  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373966 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3385  transcriptional regulator, MarR family  41.46 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.824794  hitchhiker  0.00000813466 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5035  transcriptional regulator, MarR family  41.38 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  35.14 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2015  MarR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  38.94 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  34.43 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1302  transcriptional regulator, MarR family  48.48 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  38.39 
 
 		 135 aa  63.5  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  48.48 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  34.75 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  32.79 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06310  transcriptional regulator  37.11 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2365  transcriptional regulator, MarR family  39.18 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000820566  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  45.78 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  42.16 
 
 		 160 aa  60.8  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  33.88 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7901  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 161 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  40.51 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1361  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2280  hypothetical protein  31.88 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0154888  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  43.9 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  38.78 
 
 		 138 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3659  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 157 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  32.28 
 
 		 164 aa  57  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  29.08 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  29.08 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  26.24 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  29.08 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  43.84 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3825  MarR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  29.08 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2462  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0843644  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  33.6 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  45.57 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  31.67 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  33.01 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  43.59 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  40.2 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3651  MarR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  33.6 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  32.8 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3754  transcriptional regulator, MarR family  33.56 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.852787  normal  0.231032 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 185 aa  52.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  29.91 
 
 		 146 aa  53.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 149 aa  53.5  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  39.76 
 
 		 147 aa  53.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  39.76 
 
 		 147 aa  53.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 155 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  34.45 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  33.07 
 
 		 138 aa  52.4  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 158 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  43.75 
 
 		 194 aa  52.4  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  43.75 
 
 		 194 aa  52.4  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4106  transcriptional regulator, MarR family  30.4 
 
 		 174 aa  52.4  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270127  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  38 
 
 		 159 aa  52.4  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  38.83 
 
 		 147 aa  52.4  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 		 159 aa  52.8  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0118  transcriptional regulator, MarR family  35.09 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0320638  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>