More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7901 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7901  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 161 aa  323  7e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  55.13 
 
 		 154 aa  153  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  39.84 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  36.43 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4463  hypothetical protein  36.72 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2365  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000820566  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  37.21 
 
 		 137 aa  70.5  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1302  transcriptional regulator, MarR family  37.7 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1336  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  35.19 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3868  MarR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.334531 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4328  MarR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1526  MarR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  38.37 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  30.5 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  33.73 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0087  transcriptional regulator, MarR family  29.08 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3930  MarR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627094  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4436  MarR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2133  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2015  MarR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  32.81 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0069  transcriptional regulator, MarR family  29.08 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5869  MarR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.263359 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  36.89 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1411  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2109  MarR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  34.65 
 
 		 292 aa  53.5  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4913  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.582328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0983  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  40.74 
 
 		 277 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 146 aa  53.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04231  Homoprotocatechuate degradative operon repressor  26.52 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3651  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 207 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 173 aa  52.4  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 148 aa  52.4  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04197  hypothetical protein  26.52 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4585  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  26.52 
 
 		 148 aa  52  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  30.89 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  26.17 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0763  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 156 aa  51.6  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4891  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  26.52 
 
 		 148 aa  52  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 173 aa  51.6  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  31.75 
 
 		 157 aa  51.6  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  30.33 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 160 aa  51.2  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  26.17 
 
 		 160 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 160 aa  51.2  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2084  MarR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 155 aa  51.2  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0515  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 163 aa  51.2  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.628679  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 160 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 150 aa  50.8  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  26.17 
 
 		 160 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  26.17 
 
 		 160 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 160 aa  50.8  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2322  transcriptional regulator, MarR family  37.62 
 
 		 193 aa  50.8  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000287638  decreased coverage  0.000001019 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 157 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 164 aa  50.4  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 149 aa  50.4  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 160 aa  50.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  33.81 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0624  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  37.36 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  40.22 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5035  transcriptional regulator, MarR family  38.33 
 
 		 140 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 171 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  37.08 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  29.85 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1078  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  38.3 
 
 		 173 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  34.88 
 
 		 162 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2872  MarR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  normal  0.788134 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 171 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3701  MarR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.156019 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3652  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2101  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0043362  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3511  transcriptional regulator, MarR family  27.54 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.982804  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  27.74 
 
 		 179 aa  48.5  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1784  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.902391  normal  0.204207 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 169 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4136  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.332929  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 150 aa  48.5  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>