235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2872 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2872  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 156 aa  310  4.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  normal  0.788134 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4485  MarR family transcriptional regulator  52 
 
 		 160 aa  127  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.187713  normal  0.500577 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5574  MarR family transcriptional regulator  52.42 
 
 		 151 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.23947  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3929  MarR family transcriptional regulator  51.2 
 
 		 137 aa  125  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1303  MarR family transcriptional regulator  53.39 
 
 		 137 aa  122  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1198  hypothetical protein  50.4 
 
 		 137 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240784  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0006  MarR family transcriptional regulator  50.4 
 
 		 137 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862573  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4428  MarR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 137 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.400041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3966  MarR family transcriptional regulator  50.4 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529361  normal  0.146935 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0160  MarR family transcriptional regulator  50.4 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0438  MarR family transcriptional regulator  50.4 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37846  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1487  MarR family transcriptional regulator  50.4 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1402  MarR family transcriptional regulator  50.4 
 
 		 137 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1139  MarR family transcriptional regulator  50.4 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0838  transcriptional regulator, MarR family  50.85 
 
 		 137 aa  121  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3826  MarR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 158 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4542  MarR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 158 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  0.070316 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5762  MarR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 137 aa  120  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3643  MarR family transcriptional regulator  51.69 
 
 		 169 aa  120  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 277 aa  120  8e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4118  MarR family transcriptional regulator  50.4 
 
 		 137 aa  120  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1396  hypothetical protein  50.85 
 
 		 160 aa  120  9e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2629  transcriptional regulator, MarR family  47.76 
 
 		 135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1083  transcriptional regulator, MarR family  45.24 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6375  transcriptional regulator, MarR family  48.33 
 
 		 141 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6376  transcriptional regulator, MarR family  43.48 
 
 		 138 aa  110  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2430  putative transcription regulator protein  46.28 
 
 		 139 aa  110  9e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2951  MarR family transcriptional regulator  46.83 
 
 		 162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6391  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 144 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.666517 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3156  MarR family transcriptional regulator  50.41 
 
 		 141 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.646258 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2093  transcriptional regulator, MarR family  47.97 
 
 		 148 aa  107  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2698  transcriptional regulator, MarR family  43.9 
 
 		 145 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2308  transcriptional regulator, MarR family  43.9 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  hitchhiker  0.000000675191 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0314  MarR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4535  transcriptional regulator, MarR family  47.66 
 
 		 145 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0652033 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5023  MarR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 139 aa  101  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0800254  normal  0.152298 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5348  MarR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 142 aa  101  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5413  transcriptional regulator, MarR family  49.56 
 
 		 146 aa  100  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.173086 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2668  MarR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 139 aa  99.8  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5811  MarR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 155 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283873 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4133  MarR family transcriptional regulator  48.74 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3938  MarR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.556639  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6567  MarR family transcriptional regulator  45.04 
 
 		 141 aa  94.7  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0771  MarR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 138 aa  93.2  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.15812  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5962  transcriptional regulator, MarR family  45.79 
 
 		 155 aa  88.2  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2084  MarR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 155 aa  84.7  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0720  MarR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2423  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5315  transcriptional regulator, MarR family  34.68 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.342614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1336  MarR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 161 aa  52.4  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 173 aa  51.2  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0365  transcriptional regulator, MarR family  33.61 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  29.57 
 
 		 154 aa  51.2  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2948  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 159 aa  50.4  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 150 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 160 aa  50.8  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 150 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  38.37 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7901  transcriptional regulator, MarR family  38.37 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  34 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  34 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 169 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  32.79 
 
 		 167 aa  48.5  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3385  transcriptional regulator, MarR family  33.9 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.824794  hitchhiker  0.00000813466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5755  transcriptional regulator, MarR family  33.66 
 
 		 142 aa  48.5  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373966 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 150 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 147 aa  47.8  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 145 aa  47.8  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 145 aa  47.8  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 204 aa  47.8  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  29.57 
 
 		 171 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06415  transcriptional regulator marR family protein  33.77 
 
 		 139 aa  47.4  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 167 aa  47.4  0.00008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  35.42 
 
 		 159 aa  47.4  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 171 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 157 aa  47  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2241  transcriptional regulator, putative  28.04 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  28.28 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  30.84 
 
 		 180 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3332  transcriptional regulator, MarR family  33.75 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.116904  hitchhiker  0.00204772 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  29.57 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  37.84 
 
 		 173 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2312  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.986519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2280  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0185424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2233  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2487  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.229452  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  36.47 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>