More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3156 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3156  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 141 aa  278  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.646258 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6391  transcriptional regulator, MarR family  49.6 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.666517 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2872  MarR family transcriptional regulator  50.41 
 
 		 156 aa  107  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  normal  0.788134 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2093  transcriptional regulator, MarR family  49.21 
 
 		 148 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0771  MarR family transcriptional regulator  46.92 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.15812  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4535  transcriptional regulator, MarR family  50.79 
 
 		 145 aa  103  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0652033 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5348  MarR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 142 aa  103  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2951  MarR family transcriptional regulator  47.86 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5811  MarR family transcriptional regulator  50.76 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283873 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1083  transcriptional regulator, MarR family  43.55 
 
 		 149 aa  100  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3938  MarR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 145 aa  99  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.556639  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0314  MarR family transcriptional regulator  47.58 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0720  MarR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 139 aa  94.4  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3643  MarR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 169 aa  91.7  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4428  MarR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 137 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.400041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3826  MarR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 158 aa  90.5  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3966  MarR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 152 aa  90.9  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529361  normal  0.146935 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4542  MarR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 158 aa  90.5  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  0.070316 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4118  MarR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 137 aa  90.5  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5762  MarR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 137 aa  90.5  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1303  MarR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 137 aa  90.1  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  46.22 
 
 		 277 aa  89.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5574  MarR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 151 aa  89  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.23947  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2084  MarR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 155 aa  87  8e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3929  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5413  transcriptional regulator, MarR family  38.24 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.173086 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4485  MarR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 160 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.187713  normal  0.500577 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5962  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 155 aa  85.5  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1198  hypothetical protein  39.68 
 
 		 137 aa  84  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240784  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0438  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 141 aa  84  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37846  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1139  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 141 aa  84  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0160  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 141 aa  84  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0006  MarR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 137 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862573  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1402  MarR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 137 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1487  MarR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 151 aa  83.6  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2430  putative transcription regulator protein  38.46 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1396  hypothetical protein  39.2 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6375  transcriptional regulator, MarR family  40.98 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0838  transcriptional regulator, MarR family  38.71 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5315  transcriptional regulator, MarR family  41.46 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.342614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2668  MarR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 139 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2629  transcriptional regulator, MarR family  37.4 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2698  transcriptional regulator, MarR family  36.8 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2308  transcriptional regulator, MarR family  37.29 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  hitchhiker  0.000000675191 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5023  MarR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0800254  normal  0.152298 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6567  MarR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6376  transcriptional regulator, MarR family  34.35 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1172  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0004084  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1762  transcriptional regulator, MarR family  44.87 
 
 		 196 aa  57.8  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1361  transcriptional regulator, MarR family  30.91 
 
 		 159 aa  57  0.00000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0987  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4133  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  37.8 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0937  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  35 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2262  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  35 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2676  transcriptional regulator, MarR family  33.75 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1022  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  35 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.299298  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1141  homoprotocatechuate degradative operon repressor  35 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1514  homoprotocatechuate degradative operon repressor  35 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687296  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0099  homoprotocatechuate degradative operon repressor  35 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1736  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  35 
 
 		 145 aa  51.2  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0455429  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4486  transcriptional regulator, MarR family  39.24 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.021686  normal  0.0998703 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  35.43 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00668  transcriptional regulator MarR family  29.17 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2330  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3287  MarR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341859  normal  0.150177 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  26.81 
 
 		 177 aa  49.3  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3332  transcriptional regulator, MarR family  29.07 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.116904  hitchhiker  0.00204772 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  26.36 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4126  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 162 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  38.38 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4136  MarR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.332929  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 204 aa  48.9  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06415  transcriptional regulator marR family protein  32.18 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  38.38 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4230  MarR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0771683 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1784  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.902391  normal  0.204207 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0954  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0108393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3652  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2248  transcriptional regulator, TrmB  34.19 
 
 		 154 aa  47.8  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27530  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 163 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.037283 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 185 aa  47.4  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  36.71 
 
 		 162 aa  47.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 151 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 161 aa  47.4  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2205  transcriptional regulator, MarR family  29.06 
 
 		 153 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.7942 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>